RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.87□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.87□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.87□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 PTPRN2Q92932 1015 aa6.87□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 EXOC2Q96KP1 924 aa6.87□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 GNRHR2Q96P88 292 aa6.87□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 CDC6Q99741 560 aa6.87□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 CBLCQ9ULV8 474 aa6.87□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 H0Y858 1186 aa6.86□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 MAN2B1O00754 1011 aa6.86□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 AQP7O14520 342 aa6.86□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 WNT9AO14904 365 aa6.86□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 FAM153BP0C7A2 387 aa6.86□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 PYGMP11217 842 aa6.86□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.86□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 KATNBL1Q9H079 304 aa6.86□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.86□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 DEF6Q9H4E7 631 aa6.86□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.86□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.86□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 ARVCFO00192 962 aa6.85□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 ZNF623O75123 536 aa6.85□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.85□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 PDE6AP16499 860 aa6.85□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 GUCY1A3Q02108 690 aa6.85□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 GPR19Q15760 415 aa6.85□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 OSTM1Q86WC4 334 aa6.85□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.85□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 Q8TCH9 128 aa6.85□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 FBXW5Q969U6 566 aa6.85□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.85□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.85□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 E9PSI1 815 aa6.84□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 KCNK3O14649 394 aa6.84□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 C6P13671 934 aa6.84□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 KRT15P19012 456 aa6.84□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 JAM2P57087 298 aa6.84□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 Q8N1X5 172 aa6.84□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.84□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.84□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.84□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SSB-211ENST00000490914 ESYT3A0FGR9 886 aa6.83□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 FOXS1O43638 330 aa6.83□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 SELENOPP49908 381 aa6.83□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.83□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.83□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 LMF1Q96S06 567 aa6.83□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.83□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 CRTAMO95727 393 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 ATP2B1P20020 1258 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 TACR2P21452 398 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 POLD1P28340 1107 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 MC4RP32245 332 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 FIGNQ5HY92 759 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 NBPF4Q96M43 638 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.82□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 CCDC66A2RUB6 948 aa6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 MUSKO15146 869 aa6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 RRADP55042 308 aa6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 GABREP78334 506 aa6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 IL13RA1P78552 427 aa6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 SERINC3Q13530 473 aa6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 RASA3Q14644 834 aa6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.81□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 PTGS1P23219 599 aa6.8□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 GDF5P43026 501 aa6.8□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 DNM2P50570 870 aa6.8□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 ST5P78524 1137 aa6.8□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 SEC23AQ15436 765 aa6.8□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 RNF151Q2KHN1 245 aa6.8□□□□□ -1.32
SSB-211ENST00000490914 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.8□□□□□ -1.32
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