RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 CR2P20023 1033 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 CHFRQ96EP1 664 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 FAM89AQ96GI7 184 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 ESYT3A0FGR9 886 aa6.96□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.96□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 AMER2Q8N7J2 671 aa6.96□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.96□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 ACOT7O00154 380 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 INHBEP58166 350 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 GPR85P60893 370 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 DPTQ07507 201 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 RNF151Q2KHN1 245 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 Q6ZSN1 163 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 SGSM3Q96HU1 749 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 SCYL1Q96KG9 808 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 PLSCR1O15162 318 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 CDC14BO60729 498 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 SOD2P04179 222 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 OR14A2Q96R54 314 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 CEP89Q96ST8 783 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 NR2E1Q9Y466 385 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 PRODHO43272 600 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 FGFR1P11362 822 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 RRADP55042 308 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 DGCR2P98153 550 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 STYK1Q6J9G0 422 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 ALG1Q9BT22 464 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 CD244Q9BZW8 370 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 ETV4P43268 484 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 NTRK3Q16288 839 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 NSMFQ6X4W1 530 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 DPH6Q7L8W6 267 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 IPPKQ9H8X2 491 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 MSL2Q9HCI7 577 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 ACRV1P26436 265 aa6.91□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.91□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 OSBP2Q969R2 916 aa6.91□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 ST7Q9NRC1 585 aa6.91□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 ARHGAP6O43182 974 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 C1SP09871 688 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 INHBCP55103 352 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 NFYCQ13952 458 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 IL17DQ8TAD2 202 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 FBXO10Q9UK96 956 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA4-211ENST00000490435 MATN2O00339 956 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 HMGCRP04035 888 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 DUSP8Q13202 625 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 DDR2Q16832 855 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 FGRP09769 529 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.88□□□□□ -1.31
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