RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489838.5

WDR48-210, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

TSL 3

Gene WDR48, Length 360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-210ENST00000489838 CLIC6Q96NY7 704 aa7.31□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 RBPJLQ9UBG7 517 aa7.31□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 SLC12A8A0AV02 714 aa7.3□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.3□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 CD276Q5ZPR3 534 aa7.3□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 PROSER1Q86XN7 944 aa7.3□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 NIM1KQ8IY84 436 aa7.3□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa7.3□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.3□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 WRNIP1Q96S55 665 aa7.3□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 WASF3Q9UPY6 502 aa7.3□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 PLAAQ9Y263 795 aa7.3□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 A0A1B0GTL3 188 aa7.29□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 M0R2C6 588 aa7.29□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 SCDO00767 359 aa7.29□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 JMJD7P0C870 316 aa7.29□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.29□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 CPZQ66K79 652 aa7.29□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 LIPIQ6XZB0 460 aa7.29□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa7.29□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 CARFQ8N187 725 aa7.29□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 WNK4Q96J92 1243 aa7.29□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.29□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 CABP5Q9NP86 173 aa7.29□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 DLL4Q9NR61 685 aa7.29□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.28□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 CYP7B1O75881 506 aa7.28□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.28□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 CFAP100Q494V2 611 aa7.28□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.28□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.28□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 CROTQ9UKG9 612 aa7.28□□□□□ -1.24
WDR48-210ENST00000489838 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 HIP1RO75146 1068 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 CELA3BP08861 270 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 SLURP1P55000 103 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 PFKPQ01813 784 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 TAF7LQ5H9L4 462 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 SDE2Q6IQ49 451 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 OTOP1Q7RTM1 612 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 DTX3Q8N9I9 347 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 CHST14Q8NCH0 376 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 BOCQ9BWV1 1114 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.27□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 ZNF839A8K0R7 811 aa7.26□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 HSD3B2P26439 372 aa7.26□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 KCNC1P48547 511 aa7.26□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 NEK4P51957 841 aa7.26□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 IRF9Q00978 393 aa7.26□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 EFEMP1Q12805 493 aa7.26□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 PRR31Q5SQ13 230 aa7.26□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.26□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.26□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa7.26□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 MFSD3Q96ES6 412 aa7.26□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 SPATA25Q9BR10 227 aa7.26□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 KRT37O76014 449 aa7.25□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 FBXO21O94952 628 aa7.25□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 HERVK_113P62684 666 aa7.25□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 RTP5Q14D33 572 aa7.25□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 SEC23AQ15436 765 aa7.25□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.25□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.25□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.25□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.25□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.24□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 CBX4O00257 560 aa7.24□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 TRAF5O00463 557 aa7.24□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 KPNA6O60684 536 aa7.24□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 GLRBP48167 497 aa7.24□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.24□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 PHF19Q5T6S3 580 aa7.24□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 GGNQ86UU5 652 aa7.24□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 DLG3Q92796 817 aa7.24□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 L2HGDHQ9H9P8 463 aa7.24□□□□□ -1.25
WDR48-210ENST00000489838 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms