RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	ME1	P48163	572 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	STK38	Q15208	465 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	RESP18	Q5W5W9	173 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	FSIP1	Q8NA03	581 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	TEKT1	Q969V4	418 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	PBX4	Q9BYU1	374 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	TNMD	Q9H2S6	317 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	BTBD18	B2RXH4	712 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	PIK3R2	O00459	728 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	ECE2	O60344	883 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	NMT2	O60551	498 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	TSPY3	P0CV98	308 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	TSPY8	P0CW00	308 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	SCG2	P13521	617 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	CALML3	P27482	149 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	KRT2	P35908	639 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	CRK	P46108	304 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	MMP14	P50281	582 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	GRIK4	Q16099	956 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	SOGA3	Q5TF21	947 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	OLFM4	Q6UX06	510 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC17	Q96LX7	622 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	GML	Q99445	158 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	KAT14	Q9H8E8	782 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	CHD4	Q14839	1912 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	ESYT2	A0FGR8	921 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	ENTPD3	O75355	529 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	PFKFB1	P16118	471 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNA3	P22001	575 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC25B	P30305	580 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	CHRNA5	P30532	468 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SHMT1	P34896	483 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFA8	P51970	172 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	TGFB2	P61812	414 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC93	Q567U6	631 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SHC4	Q6S5L8	630 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	TTLL6	Q8N841	843 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	MKL1	Q969V6	931 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	PMEPA1	Q969W9	287 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	OSMR	Q99650	979 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	USP40	Q9NVE5	1235 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	ANO10	Q9NW15	660 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	USP25	Q9UHP3	1055 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4

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