RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486115.1

C7orf49-210, humanhuman

TSL 2

Gene C7orf49, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-210ENST00000486115 CLIC4Q9Y696 253 aa20.42■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 HAS3O00219 553 aa20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 TECP42680 631 aa20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 PSMC6P62333 389 aa20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 PDIA5Q14554 519 aa20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 STK38Q15208 465 aa20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 C7orf31Q8N865 590 aa20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 FAM167AQ96KS9 214 aa20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 USP28Q96RU2 1077 aa20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 PCYT2Q99447 389 aa20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.41■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 ARVCFO00192 962 aa20.4■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 EML1O00423 815 aa20.4■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 YEATS4O95619 227 aa20.4■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 SNX17Q15036 470 aa20.4■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.4■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.4■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.4■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.4■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
C7orf49-210ENST00000486115 POTEMA6NI47 508 aa20.39■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 CAPN15O75808 1086 aa20.39■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 MARK3P27448 753 aa20.39■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 PSMC5P62195 406 aa20.39■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 SLC39A14Q15043 492 aa20.39■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 PTPAQ15257 358 aa20.39■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 SESTD1Q86VW0 696 aa20.39■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.39■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.39■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.39■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 TRPC6Q9Y210 931 aa20.39■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 POTEB3A0JP26 581 aa20.38■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.38■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 GNAT1P11488 350 aa20.38■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 KRT85P78386 507 aa20.38■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 POTEBQ6S5H4 581 aa20.38■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.38■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 AK8Q96MA6 479 aa20.38■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 GRIN2DO15399 1336 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 HBP1O60381 514 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 CDK7P50613 346 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 RTP1P59025 263 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 PRKCEQ02156 737 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 PLCB4Q15147 1175 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 BANK1Q8NDB2 785 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 LXNQ9BS40 222 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 BRCA2P51587 3418 aa20.37■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 NRCAMQ92823 1304 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 SPTLC2O15270 562 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 OATP04181 439 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 PPFIA1Q13136 1202 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 UGCGQ16739 394 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 TRIM60Q495X7 471 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 XKR3Q5GH77 459 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 KRT79Q5XKE5 535 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 DYDC2Q96IM9 177 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 TOX2Q96NM4 488 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
C7orf49-210ENST00000486115 COL1A2P08123 1366 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms