RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 SWSAP1Q6NVH7 229 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 SV2BQ7L1I2 683 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 TINF2Q9BSI4 451 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 KATNBL1Q9H079 304 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 ALDH1A1P00352 501 aa20.2■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 USP6NLQ92738 828 aa20.2■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 CDHR1Q96JP9 859 aa20.2■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 TRIM9Q9C026 710 aa20.2■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 USP25Q9UHP3 1055 aa20.2■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 ADCY6O43306 1168 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 ARSHQ5FYA8 562 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 DNM3Q9UQ16 869 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 SPATA20Q8TB22 786 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 WDR64B1ANS9 1081 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 B4DLN1 442 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 KLRC4O43908 158 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 SLC12A3P55017 1021 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 KRT76Q01546 638 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 DDX12PQ92771 950 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 STK17AQ9UEE5 414 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF862O60290 1169 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 ASIC1P78348 528 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 LUZP1Q86V48 1076 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 GPBP1Q86WP2 473 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 NFASCO94856 1347 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 MAP2K2P36507 400 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 NLRP12P59046 1061 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 SP3Q02447 781 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 PRKCZQ05513 592 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 GDAQ9Y2T3 454 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 IDEP14735 1019 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 CYP11B2P19099 503 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 FLT3LGP49771 235 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 NPEPPSP55786 919 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 MORC3Q14149 939 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 STX1AQ16623 288 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 TRIM50Q86XT4 487 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 CUEDC2Q9H467 287 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 SFI1A8K8P3 1242 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 BACH1O14867 736 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 ACVR2BQ13705 512 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 PCYT2Q99447 389 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 SMC2O95347 1197 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 RSPH10BP0C881 870 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 TGFB3P10600 412 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 SMPD1P17405 629 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 JAK3P52333 1124 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 FCGRTP55899 365 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 TRIM32Q13049 653 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 CBX8Q9HC52 389 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms