RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.48■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 C7orf61Q8IZ16 206 aa24.48■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.48■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 TRPC6Q9Y210 931 aa24.48■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 MARK3P27448 753 aa24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 CDK7P50613 346 aa24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 TLE2Q04725 743 aa24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 SESTD1Q86VW0 696 aa24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM167AQ96KS9 214 aa24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 GABBR1Q9UBS5 961 aa24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 GRIN2DO15399 1336 aa24.46■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 F13A1P00488 732 aa24.46■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 PRPHP41219 470 aa24.46■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 B3GNT9Q6UX72 402 aa24.46■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 ERMNQ8TAM6 284 aa24.46■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 NEK9Q8TD19 979 aa24.46■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 STK24Q9Y6E0 443 aa24.46■■□□□ 1.51
RALGPS1-212ENST00000472427 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 CLTBP09497 229 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 EPHA7Q15375 998 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 PCYT2Q99447 389 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 NRCAMQ92823 1304 aa24.44■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 TECP42680 631 aa24.44■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 PPFIA1Q13136 1202 aa24.44■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 POTEB3A0JP26 581 aa24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 P4HBP07237 508 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 PSMC5P62195 406 aa24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 PLCB4Q15147 1175 aa24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 PTGISQ16647 500 aa24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 POTEBQ6S5H4 581 aa24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ATP8B4Q8TF62 1192 aa24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.43■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ALPK3Q96L96 1907 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 EML1O00423 815 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 HBP1O60381 514 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 B4GALT4O60513 344 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 QARSP47897 775 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 OATP04181 439 aa24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 NUCB2P80303 420 aa24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 PRKCEQ02156 737 aa24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 PDIA5Q14554 519 aa24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 GRIK4Q16099 956 aa24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 BANK1Q8NDB2 785 aa24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 COL1A2P08123 1366 aa24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 MYH15Q9Y2K3 1946 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 POTEMA6NI47 508 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 BRD1O95696 1058 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 CD4P01730 458 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 FAAP100Q0VG06 881 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 PKP1Q13835 747 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 XKR3Q5GH77 459 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ATL3Q6DD88 541 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 LXNQ9BS40 222 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 PDLIM7Q9NR12 457 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 SETD4Q9NVD3 440 aa24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-212ENST00000472427 IGBP1P78318 339 aa24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 DYDC2Q96IM9 177 aa24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 INSRRP14616 1297 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-212ENST00000472427 CYP4A11Q02928 519 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms