RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 CPA1P15085 419 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 MARK3P27448 753 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTMR1Q13613 665 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 LPIN1Q14693 890 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRIK4Q16099 956 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEPT8Q92599 483 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNB2Q92953 911 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANO3Q9BYT9 981 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD320Q9NPF0 282 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM260Q9NX78 707 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 COG5Q9UP83 839 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 INSL6Q9Y581 213 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 NFASCO94856 1347 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 EDIL3O43854 480 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 UPP2O95045 317 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATG7O95352 703 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 GHRP10912 638 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNAT1P11488 350 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 INSRRP14616 1297 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPFIA1Q13136 1202 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 RTN1Q16799 776 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 EPC2Q52LR7 807 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 APBB2Q92870 758 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 HLA-CQ95604 372 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDHR1Q96JP9 859 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 TUBE1Q9UJT0 475 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDY2AQ9Y6F7 541 aa9.68□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM86B1E9PN63 330 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 H3BNC9 293 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 MEIS1O00470 390 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAFGO15525 162 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBTB43O43298 467 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCNE2O96020 404 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM86B2P0C5J1 330 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 SREBF1P36956 1147 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 NAPAP54920 295 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACTR2P61160 394 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 COL19A1Q14993 1142 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLCB4Q15147 1175 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 PKN1Q16512 942 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAF2Q6P1X5 1199 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXD4L1Q9NU39 408 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 BARHL2Q9NY43 387 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC9A2Q9UBY0 812 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLXNA3P51805 1871 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 MUC6Q6W4X9 2439 aa9.67□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.66□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMCO2A6NFE2 343 aa9.66□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.66□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 GOLGA8BA8MQT2 603 aa9.66□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.66□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ENPP3O14638 875 aa9.66□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDC45O75419 566 aa9.66□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP4AP20648 1035 aa9.66□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 COL9A1P20849 921 aa9.66□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 RCAN1P53805 252 aa9.66□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGBP1P78318 339 aa9.66□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 APOBRQ0VD83 1088 aa9.66□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 NTRK3Q16288 839 aa9.66□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 AAK1Q2M2I8 961 aa9.66□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEP55Q53EZ4 464 aa9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms