RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445998.1

UBQLN3-202, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene UBQLN3, Length 817 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-202ENST00000445998 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 BRD1O95696 1058 aa15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 P4HBP07237 508 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 TECP42680 631 aa15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 CHMP4BP1P59074 171 aa15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 NBR1Q14596 966 aa15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 NCAPH2Q6IBW4 605 aa15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 CKAP2LQ8IYA6 745 aa15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 GJA10Q969M2 543 aa15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 FAM167AQ96KS9 214 aa15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 NRBP2Q9NSY0 501 aa15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 VAV3Q9UKW4 847 aa15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 CFAP45Q9UL16 551 aa15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 NRCAMQ92823 1304 aa15.47■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 RRN3P2A6NIE6 340 aa15.47■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 HBP1O60381 514 aa15.47■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 EVI5O60447 810 aa15.47■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 RTP1P59025 263 aa15.47■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 PSMC5P62195 406 aa15.47■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 PSMC6P62333 389 aa15.47■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 LRRC26Q2I0M4 334 aa15.47■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.47■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 DPF3Q92784 378 aa15.47■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.47■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 GABBR1Q9UBS5 961 aa15.47■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 POTEB3A0JP26 581 aa15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 MUTP22033 750 aa15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 QARSP47897 775 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 SPIRE1Q08AE8 756 aa15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 POTEBQ6S5H4 581 aa15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 PCYT2Q99447 389 aa15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 RNPEPQ9H4A4 650 aa15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 LRWD1Q9UFC0 647 aa15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 TELO2Q9Y4R8 837 aa15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 NR2E3Q9Y5X4 410 aa15.46■□□□□ 0.07
UBQLN3-202ENST00000445998 GRIN2DO15399 1336 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 TCHHQ07283 1943 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 C17orf102A2RUQ5 167 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 EML1O00423 815 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 SLC39A14Q15043 492 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 XKR3Q5GH77 459 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 ZNF484Q5JVG2 852 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 HAUS3Q68CZ6 603 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 OTUD6AQ7L8S5 288 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 TRIM50Q86XT4 487 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 IGSF22Q8N9C0 903 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 ATP8B4Q8TF62 1192 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 AK8Q96MA6 479 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 TUFT1Q9NNX1 390 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 TRPC6Q9Y210 931 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 NOD1Q9Y239 953 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 CLIC4Q9Y696 253 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 COL1A2P08123 1366 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 ALPK3Q96L96 1907 aa15.45■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 SLC26A4O43511 780 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 YEATS4O95619 227 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 MARK3P27448 753 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 DDIT3P35638 169 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 LONP1P36776 959 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 NASPP49321 788 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 TLE2Q04725 743 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 PKP1Q13835 747 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 PLCB4Q15147 1175 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 STK38Q15208 465 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 PTGISQ16647 500 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 TRIM60Q495X7 471 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 FAM173BQ6P4H8 233 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 FAM126BQ8IXS8 530 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 C4orf19Q8IY42 314 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 EXOC8Q8IYI6 725 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 USP28Q96RU2 1077 aa15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
UBQLN3-202ENST00000445998 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms