RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	ANO3	Q9BYT9	981 aa		20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	SETD4	Q9NVD3	440 aa		20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		20.27	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	SMCO2	A6NFE2	343 aa		20.27	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		20.27	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	AMH	P03971	560 aa		20.27	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	RSPH10B	P0C881	870 aa		20.27	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	GNAT1	P11488	350 aa		20.27	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	THPO	P40225	353 aa		20.27	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	FGD1	P98174	961 aa		20.27	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	AP3B2	Q13367	1082 aa		20.27	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	PGBD1	Q96JS3	809 aa		20.27	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		20.27	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	NRCAM	Q92823	1304 aa		20.27	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		20.26	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	SREBF1	P36956	1147 aa		20.26	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	EVC	P57679	992 aa		20.26	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	20.26	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		20.26	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		20.26	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	20.26	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		20.26	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	20.26	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		20.26	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	MYO7A	Q13402	2215 aa		20.26	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	ESYT2	A0FGR8	921 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR33	A8MZF0	331 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	SCG2	P13521	617 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	IL9	P15248	144 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMA5	P28066	241 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	NTRK3	Q16288	839 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	PKN1	Q16512	942 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	PTPRO	Q16827	1216 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	CEP55	Q53EZ4	464 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	SAMD11	Q96NU1	681 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM260	Q9NX78	707 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	NFASC	O94856	1347 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	MEIS1	O00470	390 aa		20.24	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	20.24	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	ALAD	P13716	330 aa		20.24	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	20.24	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	EPC2	Q52LR7	807 aa		20.24	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	RPAIN	Q86UA6	219 aa		20.24	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	NEK9	Q8TD19	979 aa		20.24	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		20.24	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	PCYT2	Q99447	389 aa		20.24	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	20.24	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	AR	P10275	920 aa		20.23	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP4	P98171	946 aa		20.23	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM26D	Q5JW98	314 aa		20.23	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		20.23	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		20.23	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		20.23	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	20.22	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BNC9	293 aa		20.22	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	20.22	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		20.22	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	RUFY3	Q7L099	469 aa		20.22	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		20.22	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	BANK1	Q8NDB2	785 aa		20.22	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	SEPT8	Q92599	483 aa		20.22	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	TOP1MT	Q969P6	601 aa		20.22	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		20.22	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	20.22	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAMTS3	O15072	1205 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	NEFL	P07196	543 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP3A4	P08684	503 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	CTSH	P09668	335 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	IFNAR1	P17181	557 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	MARK3	P27448	753 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	PPFIA1	Q13136	1202 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	GPM6B	Q13491	265 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	GRIK4	Q16099	956 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	GLG1	Q92896	1179 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	PHKB	Q93100	1093 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	YME1L1	Q96TA2	773 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	SDF4	Q9BRK5	362 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	20.21	■□□□□ 0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM86B1	E9PN63	330 aa		20.2	■□□□□ 0.82
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	20.2	■□□□□ 0.82

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