RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 ABCC6O95255 1503 aa14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 A0A1W2PRG0 241 aa14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 PTK2Q05397 1052 aa14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC38Q502W7 563 aa14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 HOOK3Q86VS8 718 aa14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 CFBP00751 764 aa14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 KCNK18Q7Z418 384 aa14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 SFR1Q86XK3 245 aa14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 GGA1Q9UJY5 639 aa14.99□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 RASA1P20936 1047 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 PRPHP41219 470 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 CENPPQ6IPU0 288 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 USP17L10C9JJH3 530 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 PDE6BP35913 854 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 RAB17Q9H0T7 212 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 SWAP70Q9UH65 585 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 CACNB3P54284 484 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.018e-8■■■■□ 21.4
SGMS1-203ENST00000429490 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 MRC1P22897 1456 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 PTGISQ16647 500 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 ANKS1AQ92625 1134 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 KLC4Q9NSK0 619 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 USP40Q9NVE5 1235 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 HSD17B3P37058 310 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 SNX1Q13596 522 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 LRRC14Q15048 493 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 A0A1W2PQJ5 194 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF233A6NK53 670 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 ITGA4P13612 1032 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 NFIXQ14938 502 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 DOK7Q18PE1 504 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 TBK1Q9UHD2 729 aa14.97□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.96□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 ANKRD62A6NC57 917 aa14.96□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.96□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.96□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 USP38Q8NB14 1042 aa14.96□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.96□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.96□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.96□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 CHUKO15111 745 aa14.96□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 PPP2R2AP63151 447 aa14.96□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC63Q8NA47 563 aa14.96□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 PNMA2Q9UL42 364 aa14.96□□□□□ -0.01
SGMS1-203ENST00000429490 AKR1B1P15121 316 aa14.96□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 NAB2Q15742 525 aa14.96□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 PBKQ96KB5 322 aa14.96□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 C8orf37Q96NL8 207 aa14.96□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 ACSL3O95573 720 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 MMEP08473 750 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 DR1Q01658 176 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 PSMD2Q13200 908 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 GLG1Q92896 1179 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 RPS6KA5O75582 802 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 NEBLO76041 1014 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 TRIM49P0CI25 452 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms