RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 NEK9Q8TD19 979 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 LXNQ9BS40 222 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 AZI2Q9H6S1 392 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF302Q9NR11 478 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 ADAMTS4O75173 837 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 PPFIA4O75335 1185 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 MED24O75448 989 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 UBE2HP62256 183 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 GNASQ5JWF2 1037 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 LHX8Q68G74 356 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 TPH2Q8IWU9 490 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 FSIP1Q8NA03 581 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 CALML4Q96GE6 196 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 DEFB118Q96PH6 123 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 EMSYQ7Z589 1322 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1B0GVL5 298 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 POTEB3A0JP26 581 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 CTAGE5O15320 804 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF286BP0CG31 522 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 RPA1P27694 616 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 MCM4P33991 863 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 POTEBQ6S5H4 581 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM50Q86XT4 487 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 GLG1Q92896 1179 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 BRCA2P51587 3418 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 SLITRK3O94933 977 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 LGALS2P05162 132 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 PFKFB1P16118 471 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 STAT5BP51692 787 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 PSMC5P62195 406 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 UGCGQ16739 394 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 RNF180Q86T96 592 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 PLIN2Q99541 437 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 LMBRD1Q9NUN5 540 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 ARID2Q68CP9 1835 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 ZEB2O60315 1214 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 LGR5O75473 907 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 MYL3P08590 195 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 POTEGQ6S5H5 508 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 PDILTQ8N807 584 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 PCYT2Q99447 389 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 PANK2Q9BZ23 570 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXA4-202ENST00000428284 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 NKX3-2P78367 333 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 ECM1Q16610 540 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 KCNH3Q9ULD8 1083 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 SLC26A4O43511 780 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 CST5P28325 142 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 GRB10Q13322 594 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC41Q15345 812 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 KLHDC9Q8NEP7 349 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 PNMA5Q96PV4 448 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 PLCG1P19174 1290 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 MARK3P27448 753 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 NDUFA8P51970 172 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 HYIQ5T013 277 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA4-202ENST00000428284 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.7 ms