RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.39■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.39■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.39■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 IL23AQ9NPF7 189 aa20.39■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 SAMM50Q9Y512 469 aa20.39■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 CHMP2AO43633 222 aa20.38■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 IQCF3P0C7M6 154 aa20.38■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 SWSAP1Q6NVH7 229 aa20.38■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.38■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 SERINC5Q86VE9 423 aa20.38■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.38■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.38■□□□□ 0.85
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HERC3-205ENST00000426683 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.38■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 ZNF302Q9NR11 478 aa20.38■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 TRPC6Q9Y210 931 aa20.38■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 KIF3AQ9Y496 699 aa20.38■□□□□ 0.85
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HERC3-205ENST00000426683 PSAPP07602 524 aa20.37■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 CKBP12277 381 aa20.37■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 ADAM17P78536 824 aa20.37■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 RBL2Q08999 1139 aa20.37■□□□□ 0.85
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HERC3-205ENST00000426683 SLC26A2P50443 739 aa20.36■□□□□ 0.85
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HERC3-205ENST00000426683 TMEM240Q5SV17 173 aa20.36■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 ZNF365Q70YC5 407 aa20.36■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.36■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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HERC3-205ENST00000426683 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.36■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.36■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 POTEB3A0JP26 581 aa20.35■□□□□ 0.85
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HERC3-205ENST00000426683 SFNP31947 248 aa20.35■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 RFC2P35250 354 aa20.35■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 THPOP40225 353 aa20.35■□□□□ 0.85
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HERC3-205ENST00000426683 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
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HERC3-205ENST00000426683 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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HERC3-205ENST00000426683 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 TBX3O15119 743 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 FGBP02675 491 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 HAS1Q92839 578 aa20.34■□□□□ 0.85
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HERC3-205ENST00000426683 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 KIF28PB7ZC32 967 aa20.33■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 WNT7AO00755 349 aa20.33■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 HBP1O60381 514 aa20.33■□□□□ 0.85
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HERC3-205ENST00000426683 ATP2B1P20020 1258 aa20.33■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 ATP4AP20648 1035 aa20.33■□□□□ 0.85
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HERC3-205ENST00000426683 RDM1Q8NG50 284 aa20.33■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.33■□□□□ 0.85
HERC3-205ENST00000426683 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 CUL4AQ13619 759 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 VAV3Q9UKW4 847 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 NEMFO60524 1076 aa20.31■□□□□ 0.84
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