RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 MCM8Q9UJA3 840 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A087X0T9 212 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM228BP0C875 321 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP2B4P23634 1241 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP4CP60510 307 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 ESYT2A0FGR8 921 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA6L10A6NI86 522 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC121Q6ZUS5 278 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB34Q9BZG1 259 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 C6orf229H3BNL8 230 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 BTDP43251 543 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 TNNI2P48788 182 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 TNNC1P63316 161 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 GSTO1P78417 241 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 PDIA5Q14554 519 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC18A3Q16572 532 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 UIMC1Q96RL1 719 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 CENPHQ9H3R5 247 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP83Q9Y592 693 aa20.08■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 GMNCA6NCL1 334 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 C21orf2O43822 256 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 HSD17B3P37058 310 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 ADCY7P51828 1080 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMD2Q13200 908 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 NEDD9Q14511 834 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL7Q8IXQ5 586 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 USP38Q8NB14 1042 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC114Q96M63 670 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 ISCUQ9H1K1 167 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 SUFUQ9UMX1 484 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 H0YGN5 161 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 MYZAPP0CAP1 466 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 C3orf20Q8ND61 904 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 PANK4Q9NVE7 773 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 NFS1Q9Y697 457 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 ECHS1P30084 290 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 ERVK-9P63128 1117 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 RIMBP2O15034 1052 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 MMP10P09238 476 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 PDHBP11177 359 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 CDR1P51861 262 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 UBE2SQ16763 222 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 WLSQ5T9L3 541 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 TEX11Q8IYF3 940 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 OR2W6PQ8NHA6 318 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAPPC3O43617 180 aa20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 IL1R1P14778 569 aa20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 RXRBP28702 533 aa20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 SMARCA1P28370 1054 aa20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 PPARDQ03181 441 aa20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 QPCTQ16769 361 aa20.05■□□□□ 0.8
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPROQ16827 1216 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms