RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	PSAP	P07602	524 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	MUT	P22033	750 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	CYP2C19	P33261	490 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	AFM	P43652	599 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF445	P59923	1031 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	IRF5	Q13568	498 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	ACVR2B	Q13705	512 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	MTR	Q99707	1265 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964		E9PMD0	336 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	HOXD10	P28358	340 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	MCM6	Q14566	821 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	UGCG	Q16739	394 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	SV2B	Q7L1I2	683 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	STAM	Q92783	540 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	COPS5	Q92905	334 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	DNM3	Q9UQ16	869 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SMC2	O95347	1197 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	LYPLA2	O95372	231 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	GNRH1	P01148	92 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	GH1	P01241	217 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	MYL1	P05976	194 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PLA2G4B	P0C869	781 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PSMC5	P62195	406 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PSMC6	P62333	389 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	DPYD	Q12882	1025 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ARID2	Q68CP9	1835 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TRIB2	Q92519	343 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A087WWV3	80 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	BACH1	O14867	736 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ATG7	O95352	703 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	EYA4	O95677	639 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SMPD1	P17405	629 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PTGS1	P23219	599 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	CASP1	P29466	404 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	AMPD3	Q01432	767 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TYRO3	Q06418	890 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	CUL4B	Q13620	913 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	LAMC2	Q13753	1193 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	SMARCE1	Q969G3	411 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	NACC1	Q96RE7	527 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	GPR20	Q99678	358 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-208	ENST00000420964	MYMK	A6NI61	221 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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