RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 ZDHHC9Q9Y397 364 aa23.19■■□□□ 1.3
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PTPRJ-201ENST00000418331 Q3C1V9 767 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRJ-201ENST00000418331 SNX25Q9H3E2 840 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRJ-201ENST00000418331 JAK3P52333 1124 aa23.18■■□□□ 1.3
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PTPRJ-201ENST00000418331 E9PMD0 336 aa23.17■■□□□ 1.3
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PTPRJ-201ENST00000418331 C7orf31Q8N865 590 aa23.16■■□□□ 1.3
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PTPRJ-201ENST00000418331 NLRP4Q96MN2 994 aa23.14■■□□□ 1.3
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PTPRJ-201ENST00000418331 MYO1EQ12965 1108 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP1R16BQ96T49 567 aa23.14■■□□□ 1.29
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PTPRJ-201ENST00000418331 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRJ-201ENST00000418331 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRJ-201ENST00000418331 PTPRMP28827 1452 aa23.13■■□□□ 1.29
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PTPRJ-201ENST00000418331 C12orf60Q5U649 245 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRJ-201ENST00000418331 MCPH1Q8NEM0 835 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRJ-201ENST00000418331 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRJ-201ENST00000418331 WRNIP1Q96S55 665 aa23.13■■□□□ 1.29
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