RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM87BQ96K49 555 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 CD52P31358 61 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 BMPR1AP36894 532 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 MICU3Q86XE3 530 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 TMTC2Q8N394 836 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 AZI2Q9H6S1 392 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 M0QZ92 97 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 ALADP13716 330 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 PGBD1Q96JS3 809 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 JADE2Q9NQC1 790 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 SLC27A2O14975 620 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 RB1P06400 928 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 INSRRP14616 1297 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 PRR33A8MZF0 331 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 IER5Q5VY09 327 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 SDF4Q9BRK5 362 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 MTA3Q9BTC8 594 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 COL4A6Q14031 1691 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 DCXO43602 365 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 NCK2O43639 380 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 NAPAP54920 295 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 HYAL1Q12794 435 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 FANCBQ8NB91 859 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
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UBXN4-202ENST00000415164 ZP2Q05996 745 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 PAK2Q13177 524 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 PCYT2Q99447 389 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 GINS2Q9Y248 185 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 KAT6AQ92794 2004 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 MAFGO15525 162 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 DGKIO75912 1065 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 LINC00271P0C7V0 271 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 ACTR2P61160 394 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-202ENST00000415164 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 LINC01565O15544 149 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 ARP10275 920 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF76P36508 570 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 LTBRP36941 435 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 NDUFV1P49821 464 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 STAT5BP51692 787 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 PLCB4Q15147 1175 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 PADI3Q9ULW8 664 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 POTEB3A0JP26 581 aa22.06■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 BACH1O14867 736 aa22.06■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 MMP1P03956 469 aa22.06■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 STAG3L1P0CL83 205 aa22.06■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 GATMP50440 423 aa22.06■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.06■■□□□ 1.12
UBXN4-202ENST00000415164 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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