RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381218.8

ZBED1-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 2,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC181Q5TID7 509 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 IQCEQ6IPM2 695 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 MIGA2Q7L4E1 593 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 OSBPL9Q96SU4 736 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 MTMR4Q9NYA4 1195 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 BICDL2A1A5D9 508 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 USP17L10C9JJH3 530 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 DNM1LO00429 736 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 CCNE1P24864 410 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 AMPD3Q01432 767 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 SEPT2Q15019 361 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 P2RX5Q93086 422 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 SLC39A2Q9NP94 309 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 FAM198AQ9UFP1 575 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 CDC25CP30307 473 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 FUKQ8N0W3 1084 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 CALML4Q96GE6 196 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 TXKP42681 527 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 CARSP49589 748 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 ACCSLQ4AC99 568 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 DACT2Q5SW24 774 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 HAUS3Q68CZ6 603 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 FZD1Q9UP38 647 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 AKR1B10O60218 316 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 KIF11P52732 1056 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 SARNPP82979 210 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 USH1GQ495M9 461 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 ALS2CLQ60I27 953 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 MAATS1Q7Z4T9 603 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 CAMKK2Q96RR4 588 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 RIOX1Q9H6W3 641 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 STK32BQ9NY57 414 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 STIM2Q9P246 746 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 A0A1B0GUA9 196 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 ESYT2A0FGR8 921 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 ANO9A1A5B4 782 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 TACC1O75410 805 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 NOVP48745 357 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 TNNI2P48788 182 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 DGKZQ13574 1117 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 CRYMQ14894 314 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 RRAGAQ7L523 313 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 FMNL3Q8IVF7 1028 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 SH2D4AQ9H788 454 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 USP17L15C9J2P7 530 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 USP17L13C9JLJ4 530 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 USP17L11C9JVI0 530 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 USP17L18D6R9N7 530 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 USP17L22D6RA61 530 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 USP17L17D6RBQ6 530 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 USP17L19D6RCP7 530 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 USP17L20D6RJB6 530 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 TDP2O95551 362 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 GLI1P08151 1106 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 DPEP1P16444 411 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 GCKP35557 465 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 RASSF7Q02833 373 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 USP17L24Q0WX57 530 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 PTPROQ16827 1216 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 C8orf74Q6P047 294 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 USP17L6PQ6QN14 398 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 FAM114A1Q8IWE2 563 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC170Q8IYT3 715 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 MTMR8Q96EF0 704 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 MDH1P40925 334 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 PPP1R2P41236 205 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 KDM7AQ6ZMT4 941 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 MYH1P12882 1939 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 GABPAQ06546 454 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 CALCRLQ16602 461 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 QPCTQ16769 361 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 CNNM4Q6P4Q7 775 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 SV2BQ7L1I2 683 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 TRIM58Q8NG06 486 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-201ENST00000381218 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms