RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 DGKIO75912 1065 aa15.02■□□□□ -0
TRAPPC3-201ENST00000373159 CASC1Q6TDU7 716 aa15.02■□□□□ -0
TRAPPC3-201ENST00000373159 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa15.02■□□□□ -0
TRAPPC3-201ENST00000373159 CRIPAKQ8N1N5 446 aa15.02■□□□□ -0
TRAPPC3-201ENST00000373159 GLG1Q92896 1179 aa15.02■□□□□ -0
TRAPPC3-201ENST00000373159 SQORQ9Y6N5 450 aa15.02■□□□□ -0
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRC1O43663 620 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLEKHA8P1O95397 391 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 CALM1P0DP23 149 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 CALM2P0DP24 149 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 CALM3P0DP25 149 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 MARK3P27448 753 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 MCM5P33992 734 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 LIFRP42702 1097 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 HYAL1Q12794 435 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 MTMR1Q13613 665 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 TMEM87BQ96K49 555 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 JADE2Q9NQC1 790 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 CDY2AQ9Y6F7 541 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 TTC3P53804 2025 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 CCDC69A6NI79 296 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 INSRRP14616 1297 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 CAMK1Q14012 370 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 NAALADL2Q58DX5 795 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 IER5Q5VY09 327 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 NFXL1Q6ZNB6 911 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 P2RX5Q93086 422 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 UIMC1Q96RL1 719 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 PCYT2Q99447 389 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 FTHL17Q9BXU8 183 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 PCDHA6Q9UN73 950 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLAGL2Q9UPG8 496 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 KAT6AQ92794 2004 aa15□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 MMP1P03956 469 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 CD52P31358 61 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 ADAM15Q13444 863 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 KCNH6Q9H252 994 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 AZI2Q9H6S1 392 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 MBTPS2O43462 519 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 IRS1P35568 1242 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGBP1P78318 339 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 UBE2SQ16763 222 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 NME8Q8N427 588 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 FANCBQ8NB91 859 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPPL3Q8TCT6 385 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 NFASCO94856 1347 aa14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 STAG3L1P0CL83 205 aa14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 RXRAP19793 462 aa14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLCB4Q15147 1175 aa14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGFLR1Q9H665 355 aa14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 CD207Q9UJ71 328 aa14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 PADI3Q9ULW8 664 aa14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 M0QZ92 97 aa14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 LINC01565O15544 149 aa14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 TBX10O75333 385 aa14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 EYA4O95677 639 aa14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 ITGB1P05556 798 aa14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC3-201ENST00000373159 DNAJB1P25685 340 aa14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms