RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361781.6

SGMS1-202, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 3,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-202ENST00000361781 RNF14Q9UBS8 474 aa14.88□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 FGFR2P21802 821 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 NEDD9Q14511 834 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 SFR1Q86XK3 245 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 CREG2Q8IUH2 290 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 RAD54LQ92698 747 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 MTA3Q9BTC8 594 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 EPN3Q9H201 632 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 ADAMTS3O15072 1205 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 GCKP35557 465 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 AMPD2Q01433 879 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 GRM4Q14833 912 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 NSMFQ6X4W1 530 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 TNIP1Q15025 636 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 GJB7Q6PEY0 223 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 ZNF365Q70YC5 407 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 KRT15P19012 456 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 DR1Q01658 176 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 PPP2R5AQ15172 486 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 C12orf60Q5U649 245 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 PNMA2Q9UL42 364 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 STXBP3O00186 592 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 ORC4O43929 436 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 IFNB1P01574 187 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 SETDB1Q15047 1291 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 ODR4Q5SWX8 454 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 KLHL29Q96CT2 875 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 AGLP35573 1532 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 USP17L10C9JJH3 530 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 TRIM49P0CI25 452 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 TRIM49CP0CI26 452 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 PBX1P40424 430 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 PPP2R2AP63151 447 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 HVCN1Q96D96 273 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 MYO1EQ12965 1108 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 RPAINQ86UA6 219 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 CPXCR1Q8N123 301 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 NEK9Q8TD19 979 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 TLR10Q9BXR5 811 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 CACNA1FO60840 1977 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 SLC37A4O43826 429 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 POTEJP0CG39 1038 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 ZNF131P52739 623 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 ATP11AP98196 1134 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 PTK2Q05397 1052 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 SLC18A3Q16572 532 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 SPATA20Q8TB22 786 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 GLG1Q92896 1179 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 AZI2Q9H6S1 392 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 SORBS3O60504 671 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 ADCY8P40145 1251 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 PTGISQ16647 500 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 DPH6Q7L8W6 267 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-202ENST00000361781 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms