RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 PDXDC1Q6P996 788 aa11.86□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 TTC1Q99614 292 aa11.86□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 PAGR1Q9BTK6 254 aa11.86□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEM232C9JQI7 657 aa11.86□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 GNPATO15228 680 aa11.86□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 KRT75O95678 551 aa11.86□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 NR2F2P24468 414 aa11.86□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM180AQ6UWF9 173 aa11.86□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.86□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 OLFM3Q96PB7 478 aa11.86□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.86□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 BTBD18B2RXH4 712 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 F5H423 210 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 CSPG5O95196 566 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 SERPING1P05155 500 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 CENPUQ71F23 418 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 SRLQ86TD4 932 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 CADPS2Q86UW7 1296 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 POLR2MP0CAP2 368 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 MECOMQ03112 1051 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM26FQ5R3K3 315 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 FRA10AC1Q70Z53 315 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 CYP4F11Q9HBI6 524 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ATP2B4P23634 1241 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 EPHB1P54762 984 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 BTNL9Q6UXG8 535 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 LPIN2Q92539 896 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 COPEO14579 308 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 IL2RBP14784 551 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 CYTH1Q15438 398 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 FSCBQ5H9T9 825 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 VSTM4Q8IW00 320 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 TAGAPQ8N103 731 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 TRIM11Q96F44 468 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC26A7Q8TE54 656 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 P2RX5Q93086 422 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ADPGKQ9BRR6 497 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 TNRQ92752 1358 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ALAS1P13196 640 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 DDB1Q16531 1140 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ACAD11Q709F0 780 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ZBTB18Q99592 522 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 MED23Q9ULK4 1368 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 PMLP29590 882 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ADCK1Q86TW2 530 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 PLA2G4DQ86XP0 818 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ARL8AQ96BM9 186 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 RPS6KC1Q96S38 1066 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 KIAA0556O60303 1618 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 RASA4BC9J798 803 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 RASA4O43374 803 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ESRRBO95718 433 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ERFP50548 548 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 CDO1Q16878 200 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 CEP55Q53EZ4 464 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 OTULINQ96BN8 352 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 PPP1R36Q96LQ0 422 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 TAC1P20366 129 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ARID5BQ14865 1188 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ODR4Q5SWX8 454 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 DNAJC24Q6P3W2 148 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 CNBD1Q8NA66 436 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ATP5HO75947 161 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 MYO1EQ12965 1108 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 PSMD2Q13200 908 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 CUL1Q13616 776 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.513e-6■■■□□ 17.4
GTF3C1-201ENST00000356183 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 NDE1Q9NXR1 346 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ENO4A6NNW6 628 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ADCY3O60266 1144 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 UBXN2AP68543 259 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 DRP2Q13474 957 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC9A5Q14940 896 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 KRT31Q15323 416 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 RBBP7Q16576 425 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 NLRP14Q86W24 1093 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 STAP2Q9UGK3 403 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ARHGAP10A1A4S6 786 aa11.83□□□□□ -0.52
GTF3C1-201ENST00000356183 NDUFA10O95299 355 aa11.83□□□□□ -0.52
GTF3C1-201ENST00000356183 ANO4Q32M45 955 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms