RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 CALML4Q96GE6 196 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 DYDC2Q96IM9 177 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF302Q9NR11 478 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 LGR5O75473 907 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 MUTP22033 750 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 CST5P28325 142 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 QARSP47897 775 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 UBE2HP62256 183 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 CYP4A11Q02928 519 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 TPRNQ4KMQ1 711 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 GNASQ5JWF2 1037 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 USP49Q70CQ1 688 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 RGL1Q9NZL6 768 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 GABBR1Q9UBS5 961 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC39Q9UFE4 941 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 CTAGE5O15320 804 aa31.14■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 PSMC5P62195 406 aa31.14■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 BEX3Q00994 111 aa31.14■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 CATSPER3Q86XQ3 398 aa31.14■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 BANK1Q8NDB2 785 aa31.14■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 AFAP1L1Q8TED9 768 aa31.14■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 DEFB118Q96PH6 123 aa31.14■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 LXNQ9BS40 222 aa31.14■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 NT5C3AQ9H0P0 336 aa31.14■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa31.14■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 KPNA6O60684 536 aa31.13■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 SLITRK3O94933 977 aa31.13■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 LGALS2P05162 132 aa31.13■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 STAT5BP51692 787 aa31.13■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 GLG1Q92896 1179 aa31.13■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa31.13■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 WDR81Q562E7 1941 aa31.13■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 MED24O75448 989 aa31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 MCM4P33991 863 aa31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 TPH2Q8IWU9 490 aa31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 FSIP1Q8NA03 581 aa31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 ARRDC4Q8NCT1 418 aa31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 KLHDC9Q8NEP7 349 aa31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 MYADML2A6NDP7 307 aa31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 SLC26A2P50443 739 aa31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 HYIQ5T013 277 aa31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 PDXDC2PQ6P474 469 aa31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 PCYT2Q99447 389 aa31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 LMBRD1Q9NUN5 540 aa31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 KARSQ15046 597 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 KCTD17Q8N5Z5 321 aa31.11■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1B0GVL5 298 aa31.1■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 POTEB3A0JP26 581 aa31.1■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 DDX11L8A8MPP1 907 aa31.1■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 GJB1P08034 283 aa31.1■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 MYL3P08590 195 aa31.1■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC41Q15345 812 aa31.1■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 POTEBQ6S5H4 581 aa31.1■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 PFKFB1P16118 471 aa31.1■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 UGCGQ16739 394 aa31.1■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 C4orf19Q8IY42 314 aa31.1■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 C16orf70Q9BSU1 422 aa31.1■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 ERAP1Q9NZ08 941 aa31.1■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 KCNH3Q9ULD8 1083 aa31.1■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa31.09■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 LYPLA2O95372 231 aa31.09■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF286BP0CG31 522 aa31.09■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa31.09■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM50Q86XT4 487 aa31.09■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 OGDHLQ9ULD0 1010 aa31.09■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA1024Q9UPX6 916 aa31.09■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 HPSEQ9Y251 543 aa31.09■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 GRB10Q13322 594 aa31.08■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 POTEGQ6S5H5 508 aa31.08■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 CKAP2LQ8IYA6 745 aa31.08■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
GIPC1-201ENST00000345425 H3BRB1 525 aa31.07■■■□□ 2.56
GIPC1-201ENST00000345425 PURAQ00577 322 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
GIPC1-201ENST00000345425 KCNA10Q16322 511 aa31.07■■■□□ 2.56
GIPC1-201ENST00000345425 ECM1Q16610 540 aa31.07■■■□□ 2.56
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM119Q4V9L6 283 aa31.07■■■□□ 2.56
GIPC1-201ENST00000345425 RRAGBQ5VZM2 374 aa31.07■■■□□ 2.56
GIPC1-201ENST00000345425 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
GIPC1-201ENST00000345425 FAM167AQ96KS9 214 aa31.07■■■□□ 2.56
GIPC1-201ENST00000345425 PNMA5Q96PV4 448 aa31.07■■■□□ 2.56
GIPC1-201ENST00000345425 KATNAL1Q9BW62 490 aa31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms