RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 HLFQ16534 295 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 PALLDQ8WX93 1383 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 CCT5P48643 541 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 SPOPLQ6IQ16 392 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 TTLL6Q8N841 843 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 MX2P20592 715 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF449Q6P9G9 518 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 TLK1Q9UKI8 766 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 USP17L5A8MUK1 530 aa24.14■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 EXT2Q93063 718 aa24.14■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.14■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 THNSL1Q8IYQ7 743 aa24.14■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.14■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 THAP9Q9H5L6 903 aa24.14■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 ELF1P32519 619 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
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PTPRM-201ENST00000332175 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa24.14■■□□□ 1.45
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PTPRM-201ENST00000332175 RNF217Q8TC41 542 aa24.14■■□□□ 1.45
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF394Q53GI3 561 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 TTC30BQ8N4P2 665 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 Q9H521 79 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 K7ERI5 159 aa24.13■■□□□ 1.45
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PTPRM-201ENST00000332175 COA1Q9GZY4 146 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 ATG3Q9NT62 314 aa24.13■■□□□ 1.45
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PTPRM-201ENST00000332175 SUN1O94901 812 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.13■■□□□ 1.45
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PTPRM-201ENST00000332175 USP6P35125 1406 aa24.13■■□□□ 1.45
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PTPRM-201ENST00000332175 MT-ND3P03897 115 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 GAS2L3Q86XJ1 694 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 MED4Q9NPJ6 270 aa24.12■■□□□ 1.45
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PTPRM-201ENST00000332175 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 ARMCX2Q7L311 632 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 PCGF5Q86SE9 256 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 SCYL3Q8IZE3 742 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 FGD4Q96M96 766 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 ZBED2Q9BTP6 218 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 ABCB11O95342 1321 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 WDR64B1ANS9 1081 aa24.11■■□□□ 1.45
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PTPRM-201ENST00000332175 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.11■■□□□ 1.45
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PTPRM-201ENST00000332175 CYP27A1Q02318 531 aa24.11■■□□□ 1.45
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PTPRM-201ENST00000332175 PSMA2P25787 234 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 BBS9Q3SYG4 887 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 ERICH1Q86X53 443 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 KRT33BQ14525 404 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 APBA1Q02410 837 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 ABCD1P33897 745 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
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PTPRM-201ENST00000332175 KRT10P13645 584 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 MTMR1Q13613 665 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 POLD4Q9HCU8 107 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 NEDD4P46934 1319 aa24.1■■□□□ 1.45
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