RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 CLCN5P51795 746 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 PGM5Q15124 567 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 STOX1Q6ZVD7 989 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 KREMEN2Q8NCW0 462 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 SUSD6Q92537 303 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 CASP10Q92851 521 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 EVI5LQ96CN4 794 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 CDHR1Q96JP9 859 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 VAT1LQ9HCJ6 419 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 COL20A1Q9P218 1284 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 RRN3P2A6NIE6 340 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 FIBPO43427 364 aa9.1□□□□□ -0.95
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PGGT1B-201ENST00000296642 PPFIA3O75145 1194 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 SCG2P13521 617 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 RFX1P22670 979 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 TECP42680 631 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 GHRHRQ02643 423 aa9.1□□□□□ -0.95
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PGGT1B-201ENST00000296642 PPFIA1Q13136 1202 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 PAK2Q13177 524 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 HIC1Q14526 733 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 NLRX1Q86UT6 975 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D5Q92609 795 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 RTP3Q9BQQ7 232 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 DCTPP1Q9H773 170 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBE1Q9UJT0 475 aa9.1□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 KAT6AQ92794 2004 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF213O14771 459 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 FGAP02671 866 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRNA1P02708 482 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00271P0C7V0 271 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 SDHBP21912 280 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 MTHFRP42898 656 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT17Q04695 432 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 CAMK1Q14012 370 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 LPIN1Q14693 890 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 DUSP6Q16828 381 aa9.09□□□□□ -0.95
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PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 XRRA1Q6P2D8 792 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 CUL5Q93034 780 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR20Q99678 358 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 HINFPQ9BQA5 517 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 LZTS1Q9Y250 596 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 CDY2AQ9Y6F7 541 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO7AQ13402 2215 aa9.09□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 MYH6P13533 1939 aa9.08□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 CARNS1A5YM72 827 aa9.08□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 PER2O15055 1255 aa9.08□□□□□ -0.96
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PGGT1B-201ENST00000296642 RGS20O76081 388 aa9.08□□□□□ -0.96
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PGGT1B-201ENST00000296642 MX1P20591 662 aa9.08□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 PPM1AP35813 382 aa9.08□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIK4Q16099 956 aa9.08□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.08□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.08□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.08□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 GLG1Q92896 1179 aa9.08□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.08□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 JMJD4Q9H9V9 463 aa9.08□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM260Q9NX78 707 aa9.08□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.08□□□□□ -0.96
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