RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC41Q15345 812 aa10.4□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 UGCGQ16739 394 aa10.4□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf186Q6ZWK4 172 aa10.4□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 NLRX1Q86UT6 975 aa10.4□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 P2RX5Q93086 422 aa10.4□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 POLD4Q9HCU8 107 aa10.4□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa10.4□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 RSPH10B2B2RC85 870 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 POTEB2H3BUK9 544 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 P4HBP07237 508 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 RSPH10BP0C881 870 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 CCNE1P24864 410 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 STIM1Q13586 685 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 STXBP2Q15833 593 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 CENPPQ6IPU0 288 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 CHADLQ6NUI6 762 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSCAN30Q86W11 494 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 NEK9Q8TD19 979 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 NACC1Q96RE7 527 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D7Q9P0N9 293 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 ARID5BQ14865 1188 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM26FQ5R3K3 315 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 PNMA3Q9UL41 463 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 SAMM50Q9Y512 469 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 MCM3APO60318 1980 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GTH6 734 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT76Q01546 638 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 NR1I3Q14994 352 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD23Q86SG2 305 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC65Q8IXS2 484 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 EEF2KMTQ96G04 330 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 SENP7Q9BQF6 1050 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 EFCC1Q9HA90 598 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC10BA6NIK2 292 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 ICAM3P32942 547 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 QARSP47897 775 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 CASP5P51878 434 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 MROH8Q9H579 483 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 NFASCO94856 1347 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 PCNTO95613 3336 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR64B1ANS9 1081 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 LYPLA2O95372 231 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT18P05783 430 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R2P41236 205 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 HUNKP57058 714 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 SFNP31947 248 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 COPB2P35606 906 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 JAK3P52333 1124 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT31Q15323 416 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 GNPTABQ3T906 1256 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 TCP11X2Q5H9J9 407 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 VSTM4Q8IW00 320 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 SHCBP1Q8NEM2 672 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 SCFD1Q8WVM8 642 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 CDHR1Q96JP9 859 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM47Q96LD4 638 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM150BA6NC51 233 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP10.37□□□□□ -0.757e-9■■■□□ 16.7
RABGEF1-201ENST00000284957 TEX33O43247 280 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 CBFA2T2O43439 604 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 LRMPQ12912 555 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 TMC6Q7Z403 805 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 SFR1Q86XK3 245 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 MMP19Q99542 508 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 MYH11P35749 1972 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 SFI1A8K8P3 1242 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNJ18B7U540 433 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 SORBS3O60504 671 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 RARRES1P49788 294 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNJ12Q14500 433 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 ZCWPW2Q504Y3 356 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 SEPT14Q6ZU15 432 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 C4orf19Q8IY42 314 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 MYOCDQ8IZQ8 938 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 ZHX3Q9H4I2 956 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 THAP9Q9H5L6 903 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-201ENST00000284957 BICDL2A1A5D9 508 aa10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms