RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249377.4

LRRC17-201, Transcript of leucine rich repeat containing 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC17, Length 2,002 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17-201ENST00000249377 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.89□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 KCNK18Q7Z418 384 aa14.89□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CPVLQ9H3G5 476 aa14.89□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CD248Q9HCU0 757 aa14.89□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.89□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.89□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SNED1Q8TER0 1413 aa14.89□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 TRAF5O00463 557 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 KCNK3O14649 394 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SLC37A4O43826 429 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 MTMR3Q13615 1198 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ASIC2Q16515 512 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 WLSQ5T9L3 541 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 POTEMA6NI47 508 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ZBTB7AO95365 584 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 PPP2R2AP63151 447 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 KRT79Q5XKE5 535 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SEC14L1Q92503 715 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 TMEM260Q9NX78 707 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 MCM8Q9UJA3 840 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 MTMR7Q9Y216 660 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC188H7C350 402 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 QPCTQ16769 361 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 TDP2O95551 362 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 MMP14P50281 582 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 NEDD9Q14511 834 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 P3H4Q92791 437 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC114Q96M63 670 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 PIGSQ96S52 555 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 NENFQ9UMX5 172 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 DNM1LO00429 736 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ECM1Q16610 540 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 HYIQ5T013 277 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 FUKQ8N0W3 1084 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 TATDN2Q93075 761 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CENPHQ9H3R5 247 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 PANK4Q9NVE7 773 aa14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CEP104O60308 925 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ADRA2BP18089 450 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ANXA13P27216 316 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 TMOD1P28289 359 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms