RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.19■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 VAV3Q9UKW4 847 aa25.19■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa25.19■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 KAT6AQ92794 2004 aa25.19■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 C17orf102A2RUQ5 167 aa25.18■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 TBX3O15119 743 aa25.18■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 TREHO43280 583 aa25.18■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa25.18■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 C16orf59Q7L2K0 433 aa25.18■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 AZI2Q9H6S1 392 aa25.18■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 DISC1Q9NRI5 854 aa25.18■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 KIF3AQ9Y496 699 aa25.18■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.18■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 LAMA3Q16787 3333 aa25.18■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 RBL2Q08999 1139 aa25.17■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 PTK7Q13308 1070 aa25.17■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 MARCH8Q5T0T0 291 aa25.17■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 SERINC5Q86VE9 423 aa25.17■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 LMBR1Q8WVP7 490 aa25.17■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 MTMR9Q96QG7 549 aa25.17■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 ZNF302Q9NR11 478 aa25.17■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 NRCAMQ92823 1304 aa25.17■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 WDR64B1ANS9 1081 aa25.16■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa25.16■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 EML1O00423 815 aa25.16■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 CSF2RAP15509 400 aa25.16■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 CCL23P55773 120 aa25.16■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 SPIRE1Q08AE8 756 aa25.16■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 TRAF7Q6Q0C0 670 aa25.16■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.16■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.16■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 NOD1Q9Y239 953 aa25.16■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 PITPNM1O00562 1244 aa25.15■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 BACH1O14867 736 aa25.15■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 CHMP2AO43633 222 aa25.15■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 PSAPP07602 524 aa25.15■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 INSRRP14616 1297 aa25.15■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 ATP2B1P20020 1258 aa25.15■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 SLC26A2P50443 739 aa25.15■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 PPP2R5CQ13362 524 aa25.15■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 GPNMBQ14956 572 aa25.15■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 SCLYQ96I15 445 aa25.15■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 GABBR1Q9UBS5 961 aa25.15■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa25.15■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 ZNF862O60290 1169 aa25.14■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 SFNP31947 248 aa25.14■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 FPGSQ05932 587 aa25.14■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 PPFIA1Q13136 1202 aa25.14■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 GRIK4Q16099 956 aa25.14■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 UGCGQ16739 394 aa25.14■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 FAM160B1Q5W0V3 765 aa25.14■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 SCN5AQ14524 2016 aa25.14■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 POTEB3A0JP26 581 aa25.13■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 IQCF3P0C7M6 154 aa25.13■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 CKBP12277 381 aa25.13■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 JAK3P52333 1124 aa25.13■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 C9orf50Q5SZB4 431 aa25.13■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 PDXDC2PQ6P474 469 aa25.13■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 POTEBQ6S5H4 581 aa25.13■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 TMEM199Q8N511 208 aa25.13■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.13■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 RDM1Q8NG50 284 aa25.13■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 CAGE1Q8TC20 777 aa25.13■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 ATP8B4Q8TF62 1192 aa25.13■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.13■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 SAMM50Q9Y512 469 aa25.13■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB42B2RXF5 422 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 NEMFO60524 1076 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 STBD1O95210 358 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 GNAT1P11488 350 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 MCM7P33993 719 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC10P48553 1259 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 BFSP2Q13515 415 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 NBR1Q14596 966 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 ZNF174Q15697 407 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 RUFY4Q6ZNE9 571 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 SLFN12Q8IYM2 578 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 SHHQ15465 462 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 CALCRLQ16602 461 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 TTC38Q5R3I4 469 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 TET1Q8NFU7 2136 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 TRPC6Q9Y210 931 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPC1 479 aa25.11■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 RRN3P2A6NIE6 340 aa25.11■■□□□ 1.61
SYF2-201ENST00000236273 H3BQV1 296 aa25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms