RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Foxd1Q61345 456 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Armcx3Q8BHS6 379 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam20aQ8CID3 541 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dlk2Q8K1E3 382 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Traf7Q922B6 594 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 PpihQ9D868 188 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Limd1Q9QXD8 668 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Timm44O35857 452 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nmt1O70310 496 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mcm5P49718 733 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdrg1P59048 133 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc14bQ3UJB3 510 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tdp1Q8BJ37 609 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sox30Q8CGW4 782 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnajc17Q91WT4 303 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spdl1Q923A2 608 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr67F8VPJ8 320 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Il6stQ00560 917 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nsun6Q7TS68 476 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sh2b2Q9JID9 621 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Add1Q9QYC0 735 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plod3Q9R0E1 741 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hebp1Q9R257 190 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Orc4O88708 433 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 PrkceP16054 737 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scarf1Q5ND28 820 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stoml1Q8CI66 399 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tm4sf4Q91XD3 202 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc94Q9D6J3 314 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mxra8Q9DBV4 442 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 IydQ9DCX8 285 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 DexiQ9WUQ7 95 aa12.99□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa12.98□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cetn3O35648 167 aa12.98□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 SpibO35906 267 aa12.98□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 RdxP26043 583 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Necab1Q8BG18 352 aa12.98□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Traf3ip3Q8C0G2 513 aa12.98□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 1700129C05RikQ9CQ77 218 aa12.98□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd2bp2Q9CWK3 342 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Phtf1Q9QZ09 761 aa12.98□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mov10P23249 1004 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 A1cfQ5YD48 595 aa12.98□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Copb1Q9JIF7 953 aa12.98□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 AU015836B2RUM3 263 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mt-CybP00158 381 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fgfr4Q03142 799 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Specc1lQ2KN98 1118 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Oxsr1Q6P9R2 527 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kiaa0391Q8JZY4 584 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Matr3Q8K310 846 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf131Q8K3J5 619 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tor1aip1Q921T2 595 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hs6st3Q9QYK4 470 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nek3Q9R0A5 511 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cops5O35864 334 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 MafgO54790 162 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 GpiP06745 558 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nr2f2P43135 414 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam183bQ5NC57 135 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 IgflQ6B9Z0 140 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Asnsd1Q8BFS9 627 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zmynd15Q8C0R7 736 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Iws1Q8C1D8 766 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Btbd7Q8CFE5 1130 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 PdgfcQ8CI19 345 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpinb8O08800 374 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Becn1O88597 448 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sox5P35710 763 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 PtgdrP70263 357 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ly9Q01965 654 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spdye4aQ5IBH6 268 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pank4Q80YV4 820 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc45a1Q8BIV7 751 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim32Q8CH72 655 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kdm8Q9CXT6 414 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp2s1Q9DBX6 501 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znhit2Q9QY66 399 aa12.97□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc38A2VDH3 298 aa12.96□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 PklrP53657 574 aa12.96□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp781Q0P5U5 243 aa12.96□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Btnl9Q8BJE2 536 aa12.96□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dpp9Q8BVG4 862 aa12.96□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 HyiQ8R1F5 277 aa12.96□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf445Q8R2V3 986 aa12.96□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 NptxrQ99J85 493 aa12.96□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smtnl1Q99LM3 459 aa12.96□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smchd1Q6P5D8 2007 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm45208A0A140LJ36 292 aa12.96□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc6a16A0A1L1SR47 742 aa12.96□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 MtrA6H5Y3 1253 aa12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43 ms