RNA–Protein interactions for RNA: YOL044W

PEX15, Transcript of Tail-anchored type II integral peroxisomal membrane protein, yeast

Gene PEX15, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX15	YOL044W	CDC21	P06785	304 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	IMA3	P0CW40	589 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	IMA4	P0CW41	589 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	SPO12	P17123	173 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	SLY1	P22213	666 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	YBR056W	P38081	501 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	STN1	P38960	494 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	YPS6	P40583	537 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	ROG1	P53118	685 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	PPM1	Q04081	328 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	URH1	Q04179	340 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	TLG2	Q08144	397 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	IMA2	Q08295	589 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	FRE6	Q12473	712 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	RAD61	Q99359	647 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	PHO91	P27514	894 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	YOX1	P34161	385 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	KKQ8	P36004	724 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	SDS24	P38314	527 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	GPI16	P38875	610 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	BRO1	P48582	844 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	BOR1	P53838	576 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	IBD2	P53892	351 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	EOS1	P53938	366 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	HNT3	Q08702	217 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	RUP1	Q12242	671 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	SPT7	P35177	1332 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	DST1	P07273	309 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	HEM15	P16622	393 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	SPS22	P25380	463 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	MIX23	P38162	196 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	STP2	P38704	541 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	INM1	P38710	295 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	WSS1	P38838	269 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	FAA2	P39518	744 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	EPL1	P43572	832 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	AZR1	P50080	613 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	YIP5	P53108	310 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	MLC1	P53141	149 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	HXT11	P54862	567 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	MEH1	Q02205	184 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	STD1	Q02794	444 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	YPL107W	Q02873	248 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	MMT1	Q03218	510 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	YMR181C	Q03231	154 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	SRL2	Q12020	392 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	YDR061W	Q12298	539 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX15	YOL044W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.15	□□□□□ -1.91	not detected
PEX15	YOL044W	MTC6	P38849	526 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	MNL1	P38888	796 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	MLH1	P38920	769 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	YPI1	P43587	155 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	NCA3	P46955	337 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	NDL1	Q06568	189 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	NSE1	Q07913	336 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	NFI1	Q12216	726 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	YLR108C	Q12259	485 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	MSP1	P28737	362 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	YSC83	P32792	385 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	SKN1	P33336	771 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	MRPL4	P36517	319 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	QDR3	P38227	689 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	YIL067C	P40514	678 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	CHS6	P40955	746 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	YDR541C	Q03049	344 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	SMA2	Q04658	369 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	SKS1	Q12505	502 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	CPR4	P25334	318 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	YKL097C	P34245	136 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	YBR137W	P38276	179 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	YSW1	P38280	609 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	SPG5	P42933	373 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	ESA1	Q08649	445 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	OPI3	P05375	206 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	REV1	P12689	985 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	DAD2	P36162	133 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEX15	YOL044W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91

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