RNA–Protein interactions for RNA: YGL008C

PMA1, Transcript of Plasma membrane P2-type H+-ATPase, yeast

Gene PMA1, Length 2,757 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMA1	YGL008C	RPC34	P32910	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	RIB1	P38066	345 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	YBR259W	P38338	688 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	ALP1	P38971	573 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	SDP1	P40479	209 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	TAF6	P53040	516 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	IPK1	Q06667	281 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	SNA4	Q07549	140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	YDL176W	Q12027	708 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	MTR10	Q99189	972 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	YCR015C	P25616	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	GIP2	P40036	548 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	YER121W	P40076	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	TAX4	P47030	604 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	FHN1	P53279	174 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	UBX2	Q04228	584 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	ECM3	Q99252	613 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	ATP7	P30902	174 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	NNK1	P36003	928 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	FZO1	P38297	855 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	OPT1	P40897	799 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	OSW2	Q12202	724 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	VAM3	Q12241	283 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	SEN2	P16658	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	YBR144C	P34215	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	YBR062C	P38239	180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	STP2	P38704	541 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	SNZ3	P43545	298 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	STB4	P50104	949 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	ROG1	P53118	685 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	YGL114W	P53134	725 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	MAL13	P53338	473 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	SNZ2	P53824	298 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	MSC2	Q03455	724 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	ARO80	Q04052	950 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	HOF1	Q05080	669 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
PMA1	YGL008C	POM34	Q12445	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	CDC8	P00572	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	RAD7	P06779	565 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	MEI4	P29467	408 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	NUF2	P33895	451 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	DUG2	P38149	878 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	MSS4	P38994	779 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	ICE2	P40499	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	IRC8	P47046	822 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	DCS1	Q06151	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	YLR177W	Q06251	628 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	RMD5	Q12508	421 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	PUT2	P07275	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	RIP1	P08067	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	CNA1	P23287	553 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	YHR078W	P38799	552 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	PFS1	P38872	237 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	END3	P39013	349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	SLM1	P40485	686 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	SPC98	P53540	846 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	ASI2	P53895	289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	RIP-Chip
PMA1	YGL008C	IRC4	Q03036	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	SEC10	Q06245	871 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	MCM21	Q06675	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	CYK3	Q07533	885 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMA1	YGL008C	GAL4	P04386	881 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMA1	YGL008C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PMA1	YGL008C	YSC83	P32792	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMA1	YGL008C	LDB7	P38210	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMA1	YGL008C	SAP30	P38429	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMA1	YGL008C	AGE2	P40529	298 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMA1	YGL008C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PMA1	YGL008C	YDL186W	P48568	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMA1	YGL008C	MTL1	P53214	551 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMA1	YGL008C	UBP16	Q02863	499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMA1	YGL008C	MRP51	Q02950	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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