RNA–Protein interactions for RNA: YDL014W

NOP1, Transcript of Histone glutamine methyltransferase, modifies H2A at Q105 in nucleolus, yeast

Gene NOP1, Length 984 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NOP1	YDL014W	FDH1	Q08911	376 aa		18.6	■□□□□ 0.57
NOP1	YDL014W	YPL066W	Q12194	479 aa		18.6	■□□□□ 0.57
NOP1	YDL014W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
NOP1	YDL014W	ORC2	P32833	620 aa		18.59	■□□□□ 0.57
NOP1	YDL014W	ERF2	Q06551	359 aa		18.59	■□□□□ 0.57
NOP1	YDL014W	YOL024W	Q08172	172 aa		18.59	■□□□□ 0.57
NOP1	YDL014W	MLH3	Q12083	715 aa		18.59	■□□□□ 0.57
NOP1	YDL014W	REX3	Q12090	404 aa		18.59	■□□□□ 0.57
NOP1	YDL014W	RPB5	P20434	215 aa		18.58	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	BET3	P36149	193 aa		18.58	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	KEL2	P50090	882 aa		18.58	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	TRR2	P38816	342 aa		18.57	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	MDM30	Q05930	598 aa		18.57	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	YPR172W	Q06608	200 aa		18.57	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	NSI1	Q12457	570 aa		18.57	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	YCL049C	P25577	312 aa		18.56	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	VPS51	P36116	164 aa		18.56	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	LCL3	P53153	274 aa		18.56	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	YPR091C	Q06833	770 aa		18.56	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	YJL068C	P40363	299 aa		18.55	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	TED1	P40533	473 aa		18.55	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	ATG26	Q06321	1198 aa		18.55	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	IRA1	P18963	3092 aa		18.54	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	SAN1	P22470	610 aa		18.54	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	ATG14	P38270	344 aa		18.54	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	SPT20	P50875	604 aa		18.54	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	AKR2	Q12013	749 aa		18.54	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	RCK1	P38622	512 aa		18.53	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	CUP9	P41817	306 aa		18.53	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	APS3	P47064	194 aa		18.53	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	YMR210W	Q03649	449 aa		18.53	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	SKS1	Q12505	502 aa		18.53	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	FAD1	P38913	306 aa		18.52	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	GIP2	P40036	548 aa		18.52	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	RIC1	P40395	1056 aa		18.52	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	IKS1	P47042	667 aa		18.52	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	CDH1	P53197	566 aa		18.52	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	MFG1	Q07684	458 aa		18.52	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	BDS1	Q08347	646 aa		18.52	■□□□□ 0.56
NOP1	YDL014W	YHR177W	P38867	453 aa		18.51	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	ROM1	P53046	1155 aa		18.51	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	SUR7	P54003	302 aa		18.51	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	TPO4	Q12256	659 aa		18.51	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	SEC62	P21825	274 aa		18.5	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	TOM22	P49334	152 aa		18.5	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	OSW1	Q08692	278 aa		18.5	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	YOR365C	Q08844	703 aa		18.5	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	RNH70	P53331	553 aa		18.49	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		18.49	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	PMR1	P13586	950 aa		18.48	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	NGG1	P32494	702 aa		18.48	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	PTR2	P32901	601 aa		18.48	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	SPC42	P36094	363 aa		18.48	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	ALG5	P40350	334 aa		18.48	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	YNL033W	P53964	284 aa		18.48	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	YNL019C	P53975	284 aa		18.48	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	SMA2	Q04658	369 aa		18.48	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	DFG5	Q05031	458 aa		18.48	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	MSS18	P08593	268 aa		18.47	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	AAC3	P18238	307 aa		18.47	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	FES1	P38260	290 aa		18.47	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	MTW1	P39731	289 aa		18.47	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	AAD10	P47182	288 aa		18.47	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	PUT2	P07275	575 aa		18.46	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	MEF1	P25039	761 aa		18.46	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	MRP8	P35719	219 aa		18.46	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	ALG3	P38179	458 aa		18.46	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	GET1	P53192	235 aa		18.46	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	ACL4	Q03771	387 aa		18.46	■□□□□ 0.55
NOP1	YDL014W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
NOP1	YDL014W	MER1	P16523	270 aa		18.45	■□□□□ 0.54
NOP1	YDL014W	CLB3	P24870	427 aa		18.45	■□□□□ 0.54
NOP1	YDL014W	LAS21	P40367	830 aa		18.45	■□□□□ 0.54
NOP1	YDL014W	MAM33	P40513	266 aa		18.45	■□□□□ 0.54
NOP1	YDL014W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
NOP1	YDL014W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
NOP1	YDL014W	GPI1	P53306	609 aa		18.45	■□□□□ 0.54
NOP1	YDL014W	UGO1	Q03327	502 aa		18.45	■□□□□ 0.54
NOP1	YDL014W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54

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