RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636214.1

PNKP-225, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 5

Gene PNKP, Length 805 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-225ENST00000636214 Q6ZUG5 572 aa20.49■□□□□ 0.87
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PNKP-225ENST00000636214 ANO3Q9BYT9 981 aa20.49■□□□□ 0.87
PNKP-225ENST00000636214 CERS4Q9HA82 394 aa20.49■□□□□ 0.87
PNKP-225ENST00000636214 BARHL2Q9NY43 387 aa20.49■□□□□ 0.87
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PNKP-225ENST00000636214 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.44■□□□□ 0.86
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PNKP-225ENST00000636214 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PNKP-225ENST00000636214 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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PNKP-225ENST00000636214 BICD2Q8TD16 824 aa20.42■□□□□ 0.86
PNKP-225ENST00000636214 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PNKP-225ENST00000636214 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PNKP-225ENST00000636214 VCANP13611 3396 aa20.42■□□□□ 0.86
PNKP-225ENST00000636214 NCOR1O75376 2440 aa20.41■□□□□ 0.86
PNKP-225ENST00000636214 ESYT2A0FGR8 921 aa20.41■□□□□ 0.86
PNKP-225ENST00000636214 LCHNA4D1U4 455 aa20.41■□□□□ 0.86
PNKP-225ENST00000636214 M0QZ92 97 aa20.41■□□□□ 0.86
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