RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 A0A087X0B3 334 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 USP27XA6NNY8 438 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 MARCH6O60337 910 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 ARP10275 920 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 TXKP42681 527 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 SP3Q02447 781 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 STXBP2Q15833 593 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 CEP350Q5VT06 3117 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 MSH4O15457 936 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 EDNRBP24530 442 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 PRPHP41219 470 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 PSMC4P43686 418 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 PDE4DQ08499 809 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 PTPN14Q15678 1187 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 CEP135Q66GS9 1140 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 VSTM4Q8IW00 320 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 JADE2Q9NQC1 790 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 PAGE5Q96GU1 130 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 B4DLN1 442 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 RGS20O76081 388 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 FCGRTP55899 365 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 MAP2K5Q13163 448 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 TRIM47Q96LD4 638 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 GJD2Q9UKL4 321 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 TBX3O15119 743 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 STAM2O75886 525 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 TECP42680 631 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 MTMR1Q13613 665 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-208ENST00000635751 ASB14A6NK59 587 aa22.27■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 ZNF18P17022 549 aa22.27■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.27■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 NLRX1Q86UT6 975 aa22.27■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.27■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.27■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 USP6NLQ92738 828 aa22.27■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 MAML3Q96JK9 1138 aa22.27■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 GSDMAQ96QA5 445 aa22.27■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.27■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.27■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 GPR25O00155 361 aa22.26■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 AFMP43652 599 aa22.26■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 CAP1Q01518 475 aa22.26■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 DPYDQ12882 1025 aa22.26■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 FAM20AQ96MK3 541 aa22.26■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.26■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.26■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.26■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 CYP2B6P20813 491 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 KIF22Q14807 665 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 ARMCX2Q7L311 632 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 IQUBQ8NA54 791 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 MORC4Q8TE76 937 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 GPRASP2Q96D09 838 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 SEMA3FQ13275 785 aa22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 GNPTABQ3T906 1256 aa22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 TSC1Q92574 1164 aa22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 SLC5A5Q92911 643 aa22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 RGS2P41220 211 aa22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 E2F4Q16254 413 aa22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.24■■□□□ 1.15
CLN8-208ENST00000635751 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms