RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SELP	P16109	830 aa		18.85	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		18.85	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM50	Q86XT4	487 aa		18.85	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	HERVK_113	Q902F9	699 aa		18.85	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		18.85	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZBBX	A8MT70	800 aa		18.84	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM86B1	E9PN63	330 aa		18.84	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		18.84	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	C8orf34	Q49A92	452 aa		18.84	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		18.84	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	BLID	Q8IZY5	108 aa		18.84	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	NECAB1	Q8N987	351 aa		18.84	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		18.84	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SETD4	Q9NVD3	440 aa		18.84	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		18.84	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	NRCAM	Q92823	1304 aa		18.83	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	STK36	Q9NRP7	1315 aa		18.83	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADAMTS3	O15072	1205 aa		18.83	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	CKB	P12277	381 aa		18.83	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	MARK3	P27448	753 aa		18.83	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	THPO	P40225	353 aa		18.83	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP11	P51784	963 aa		18.83	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	ACTR2	P61160	394 aa		18.83	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	ME3	Q16798	604 aa		18.83	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRR16	Q569H4	304 aa		18.83	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	AIFM3	Q96NN9	605 aa		18.83	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		18.83	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		18.83	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q7L0L9	218 aa		18.82	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	SERINC5	Q86VE9	423 aa		18.82	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		18.82	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		18.82	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	EMSY	Q7Z589	1322 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	BACH1	O14867	736 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	TREH	O43280	583 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	CIITA	P33076	1130 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	STAT5B	P51692	787 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBL2	Q08999	1139 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPFIA1	Q13136	1202 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	TBCK	Q8TEA7	893 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	GTF3C6	Q969F1	213 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	UIMC1	Q96RL1	719 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRPC6	Q9Y210	931 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		18.81	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		18.8	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	HIC1	Q14526	733 aa		18.8	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	18.8	■□□□□ 0.6	3e-6	■□□□□ 8.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		18.8	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	RASIP1	Q5U651	963 aa		18.8	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		18.8	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		18.8	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		18.8	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM161B	Q96MY7	647 aa		18.8	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		18.8	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	MSRA	Q9UJ68	235 aa		18.8	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		18.8	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		18.79	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		18.79	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	LGR5	O75473	907 aa		18.79	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	CTDNEP1	O95476	244 aa		18.79	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	RSPH10B	P0C881	870 aa		18.79	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	HOXC8	P31273	242 aa		18.79	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC26A2	P50443	739 aa		18.79	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM29	Q14134	588 aa		18.79	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRIK4	Q16099	956 aa		18.79	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	RSPH3	Q86UC2	560 aa		18.79	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		18.79	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		18.79	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	SAMM50	Q9Y512	469 aa		18.79	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		18.78	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	CAND2	O75155	1236 aa		18.78	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATG7	O95352	703 aa		18.78	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	LARGE1	O95461	756 aa		18.78	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAJB2	P25686	324 aa		18.78	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNJ6	P48051	423 aa		18.78	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGBP1	P78318	339 aa		18.78	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRT76	Q01546	638 aa		18.78	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB30	Q15771	203 aa		18.78	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		18.78	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF302	Q9NR11	478 aa		18.78	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		18.78	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		18.77	■□□□□ 0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6

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