RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-215	ENST00000628018	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	CPA4	Q9UI42	421 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	NFASC	O94856	1347 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	YY1	P25490	414 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	MAPK4	P31152	587 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	KRT76	Q01546	638 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	IQCB1	Q15051	598 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	GPR142	Q7Z601	462 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	RMND1	Q9NWS8	449 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	MYMK	A6NI61	221 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	KLRC4	O43908	158 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	ADORA2A	P29274	412 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	KCNB1	Q14721	858 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	LUZP1	Q86V48	1076 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	MLKL	Q8NB16	471 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZIC5	Q96T25	663 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	DNM3	Q9UQ16	869 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CAPNS1-215	ENST00000628018	TLR2	O60603	784 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	PLA2G4B	P0C869	781 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	PSMC6	P62333	389 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	COBL	O75128	1261 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	CCNE2	O96020	404 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	SFN	P31947	248 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	GRB14	Q14449	540 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	C17orf99	Q6UX52	265 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	TPH2	Q8IWU9	490 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	JAK3	P52333	1124 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	SLC12A3	P55017	1021 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	RDM1	Q8NG50	284 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	ASB14	A6NK59	587 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	WDR64	B1ANS9	1081 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	RHOBTB3	O94955	611 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	SP2	Q02086	613 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	DACH1	Q9UI36	760 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	EYA4	O95677	639 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	ASIC1	P78348	528 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	BANK1	Q8NDB2	785 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	DDX12P	Q92771	950 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	LXN	Q9BS40	222 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	SAMM50	Q9Y512	469 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	TGFB3	P10600	412 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	NACC1	Q96RE7	527 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	RASSF10	A6NK89	507 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	CYP11B2	P19099	503 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	GRM1	Q13255	1194 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	UNC13D	Q70J99	1090 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	DYM	Q7RTS9	669 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	CREBZF	Q9NS37	354 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	NOG	Q13253	232 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	CRHR2	Q13324	411 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	GPBP1	Q86WP2	473 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CAPNS1-215	ENST00000628018	BECN2	A8MW95	431 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	LYPLA2	O95372	231 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	ARSH	Q5FYA8	562 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		27.76	■■■□□ 2.03

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