RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621229.1

LLGL1-203, Transcript of LLGL1, scribble cell polarity complex component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LLGL1, Length 3,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL1-203ENST00000621229 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 CLIC2O15247 247 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 TLR2O60603 784 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 SERPINB2P05120 415 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 KLRC1P26715 233 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 USP8P40818 1118 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 CARSP49589 748 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 UBXN2AP68543 259 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 C8orf74Q6P047 294 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 GJB7Q6PEY0 223 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 KSR1Q8IVT5 923 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 KRT12Q99456 494 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 PAFAH1B1P43034 410 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 CCT5P48643 541 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 BAP1Q92560 729 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 EPB41L5Q9HCM4 733 aa14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 A0A087X0T9 212 aa14.6□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 GDF11O95390 407 aa14.6□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 FAM228BP0C875 321 aa14.6□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.6□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 TLR10Q9BXR5 811 aa14.6□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 CUEDC2Q9H467 287 aa14.6□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 CHMP2AO43633 222 aa14.6□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 GLI1P08151 1106 aa14.6□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 SLC9A1P19634 815 aa14.6□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 PDXDC1Q6P996 788 aa14.6□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 RUFY1Q96T51 708 aa14.6□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.6□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 MYL1P05976 194 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 PLA2G4BP0C869 781 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 RSPH10BP0C881 870 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 KCNA1Q09470 495 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 ADAM9Q13443 819 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 PLS1Q14651 629 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 CERS5Q8N5B7 392 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 RETREG2Q8NC44 543 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 RAB34Q9BZG1 259 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 PPFIA4O75335 1185 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 PDCLQ13371 301 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 NOX5Q96PH1 765 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 CD248Q9HCU0 757 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 CASZ1Q86V15 1759 aa14.58□□□□□ -0.07
LLGL1-203ENST00000621229 MED24O75448 989 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 NOL4O94818 638 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 NAA35Q5VZE5 725 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 BARGINQ6ZT62 677 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 CUL5Q93034 780 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 PCNTO95613 3336 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 ZBTB39O15060 712 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 GNGT1P63211 74 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 SCN7AQ01118 1682 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 KCNK3O14649 394 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 KIF3CO14782 793 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 TTLL1O95922 423 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 NR2F2P24468 414 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 ZNF543Q08ER8 600 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-203ENST00000621229 HGSNATQ68CP4 663 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms