RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.37■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.37■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 CUL5Q93034 780 aa25.37■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.37■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 SORBS3O60504 671 aa25.36■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 METTL7BQ6UX53 244 aa25.36■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.36■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 PIEZO1Q92508 2521 aa25.36■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 GRXCR2A6NFK2 248 aa25.35■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 NEDD9Q14511 834 aa25.35■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 HIC1Q14526 733 aa25.35■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.35■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 SERINC5Q86VE9 423 aa25.35■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 FANCBQ8NB91 859 aa25.35■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 NEK9Q8TD19 979 aa25.35■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.35■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.35■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.34■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 LGALS2P05162 132 aa25.34■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 RSPH10BP0C881 870 aa25.34■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 DBF4BQ8NFT6 615 aa25.34■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.34■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 H3BRB1 525 aa25.33■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 CDC45O75419 566 aa25.33■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 THPOP40225 353 aa25.33■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.33■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 EPC2Q52LR7 807 aa25.33■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa25.33■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 APOA5Q6Q788 366 aa25.33■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 MICU3Q86XE3 530 aa25.33■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 NEK1Q96PY6 1258 aa25.33■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 FAM50BQ9Y247 325 aa25.33■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.33■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa25.32■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.32■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 YME1L1Q96TA2 773 aa25.32■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 GPR20Q99678 358 aa25.32■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 USP26Q9BXU7 913 aa25.32■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.32■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.32■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 H3BNC9 293 aa25.31■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 CAND2O75155 1236 aa25.31■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.31■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 BANK1Q8NDB2 785 aa25.31■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 SEPT8Q92599 483 aa25.31■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 GPRASP2Q96D09 838 aa25.31■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 C17orf102A2RUQ5 167 aa25.3■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 H3BQ06 376 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 DCXO43602 365 aa25.3■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.3■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.3■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.3■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 RASEFQ8IZ41 740 aa25.3■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 PRKAG3Q9UGI9 489 aa25.3■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 FUT2Q10981 343 aa25.29■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 GPM6BQ13491 265 aa25.29■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 COL19A1Q14993 1142 aa25.29■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.29■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 NLRX1Q86UT6 975 aa25.29■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.29■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 TOP1MTQ969P6 601 aa25.29■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 UIMC1Q96RL1 719 aa25.29■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.28■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 KCNA2P16389 499 aa25.28■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 RCAN1P53805 252 aa25.28■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 KRT32Q14532 448 aa25.28■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.28■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 CDHR1Q96JP9 859 aa25.28■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 KCNH6Q9H252 994 aa25.28■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 KAT6AQ92794 2004 aa25.28■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 ITGB5P18084 799 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 ZP2Q05996 745 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 UBE2SQ16763 222 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 TCEAL5Q5H9L2 206 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 WWC2Q6AWC2 1192 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 TRIM50Q86XT4 487 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 TMEM192Q8IY95 271 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 APBB2Q92870 758 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 RNPEPQ9H4A4 650 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.27■■□□□ 1.64
SRRT-218ENST00000620394 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.26■■□□□ 1.63
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