RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 SDF4Q9BRK5 362 aa12.6□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 KCNH7Q9NS40 1196 aa12.6□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 TPCN1Q9ULQ1 816 aa12.6□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 MEIS1O00470 390 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 PPFIA3O75145 1194 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 ACRP10323 421 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 HOXC8P31273 242 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 NLRP5P59047 1200 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 SETQ01105 290 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 PTK7Q13308 1070 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 C8orf34Q49A92 452 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 RASIP1Q5U651 963 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF365Q70YC5 407 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 C16orf59Q7L2K0 433 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 CRYGNQ8WXF5 182 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 SEPT1Q8WYJ6 367 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 HERVK_113Q902F9 699 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 SCLYQ96I15 445 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 C22orf23Q9BZE7 217 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 PKD2L1Q9P0L9 805 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 SZT2Q5T011 3432 aa12.59□□□□□ -0.39
UBXN8-209ENST00000620074 C17orf102A2RUQ5 167 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 PARNO95453 639 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 FGBP02675 491 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 IQCF3P0C7M6 154 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 ARP10275 920 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 GNAT1P11488 350 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 SCN5AQ14524 2016 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 GALNT17Q6IS24 598 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 PLA2G4DQ86XP0 818 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 TRIM50Q86XT4 487 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 DAGLBQ8NCG7 672 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 CYP2W1Q8TAV3 490 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 SLC9A2Q9UBY0 812 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 PCDHA4Q9UN74 947 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 EMSYQ7Z589 1322 aa12.58□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 FAM86B1E9PN63 330 aa12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 ADAMTS3O15072 1205 aa12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 FAM86B2P0C5J1 330 aa12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 SELPP16109 830 aa12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 XBP1P17861 261 aa12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 CIITAP33076 1130 aa12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 NEK4P51957 841 aa12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 LRRC8DQ7L1W4 858 aa12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 RASGRP4Q8TDF6 673 aa12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 GTF3C6Q969F1 213 aa12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 ERAP1Q9NZ08 941 aa12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 TELO2Q9Y4R8 837 aa12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM265A0A087WTH1 108 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 CAND2O75155 1236 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 LGR5O75473 907 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 CKBP12277 381 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 ACTN1P12814 892 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 DEFB128Q7Z7B8 93 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 SERINC5Q86VE9 423 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 BLIDQ8IZY5 108 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 DEFB123Q8N688 67 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 WASF1Q92558 559 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 GLG1Q92896 1179 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 ATP6V0A1Q93050 837 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 VWCEQ96DN2 955 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 RNPEPQ9H4A4 650 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 AZI2Q9H6S1 392 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 NRCAMQ92823 1304 aa12.56□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 KAT6AQ92794 2004 aa12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 USP11P51784 963 aa12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 ACTR2P61160 394 aa12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 HIC1Q14526 733 aa12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 NPY5RQ15761 445 aa12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 ME3Q16798 604 aa12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF697Q5TEC3 545 aa12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 OTOP2Q7RTS6 562 aa12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 LMBR1Q8WVP7 490 aa12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 AIFM3Q96NN9 605 aa12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF577Q9BSK1 485 aa12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 TBC1D22BQ9NU19 505 aa12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 SETD4Q9NVD3 440 aa12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa12.55□□□□□ -0.4
UBXN8-209ENST00000620074 M0R2N6 131 aa12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms