RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.38■□□□□ 0.85
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TRAPPC3-209ENST00000616395 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 PROB1E7EW31 1015 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 H3BRB1 525 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 DNAJB1P25685 340 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 SP2Q02086 613 aa20.37■□□□□ 0.85
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TRAPPC3-209ENST00000616395 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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TRAPPC3-209ENST00000616395 MYO15AQ9UKN7 3530 aa20.36■□□□□ 0.85
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TRAPPC3-209ENST00000616395 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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TRAPPC3-209ENST00000616395 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.36■□□□□ 0.85
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TRAPPC3-209ENST00000616395 GLP2RO95838 553 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
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TRAPPC3-209ENST00000616395 NRIP1P48552 1158 aa20.35■□□□□ 0.85
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TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.35■□□□□ 0.85
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TRAPPC3-209ENST00000616395 SETD4Q9NVD3 440 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 CFBP00751 764 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 LGALS2P05162 132 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 ICAM3P32942 547 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 ALX1Q15699 326 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 P2RX5Q93086 422 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 LAMA4Q16363 1823 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 CACNA1HO95180 2353 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRR23AA6NEV1 266 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 ENPP3O14638 875 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 KDM4AO75164 1064 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 DGKIO75912 1065 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 CHRNA1P02708 482 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 ITGB1P05556 798 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 GHRP10912 638 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTPN21Q16825 1174 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.853e-6■□□□□ 9.4
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TRAPPC3-209ENST00000616395 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRPC6Q9Y210 931 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 OPLAHO14841 1288 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 FGAP02671 866 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 GNAT1P11488 350 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 HSD17B4P51659 736 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 IL31RAQ8NI17 732 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 SEC24BO95487 1268 aa20.31■□□□□ 0.84
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TRAPPC3-209ENST00000616395 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.31■□□□□ 0.84
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TRAPPC3-209ENST00000616395 DCHS1Q96JQ0 3298 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 TGFB3P10600 412 aa20.3■□□□□ 0.84
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TRAPPC3-209ENST00000616395 ARHGAP4P98171 946 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 LPIN1Q14693 890 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 IL25Q9H293 177 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 CHMLP26374 656 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 NBL1P41271 181 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 ID4P47928 161 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-209ENST00000616395 PGM5Q15124 567 aa20.29■□□□□ 0.84
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