RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614428.4

ACACA-231, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACACA, Length 9,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-231	ENST00000614428	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	DCAF4	Q8WV16	495 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	VSNL1	P62760	191 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GPATCH11	Q8N954	259 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	BATF3	Q9NR55	127 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TAF1	P21675	1872 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	FAM187A	A6NFU0	413 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	C6orf229	H3BNL8	230 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CASP7	P55210	303 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	7.23	□□□□□ -1.25	3e-6	■■■■□ 21.6
ACACA-231	ENST00000614428	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TEC	P42680	631 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PIGB	Q92521	554 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TBX3	O15119	743 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PLA2G4A	P47712	749 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MEA1	Q16626	185 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	KRT39	Q6A163	491 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MECOM	Q03112	1051 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CCDC6	Q16204	474 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	AP5Z1	O43299	807 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CIB2	O75838	187 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	BBOX1	O75936	387 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TROAP	Q12815	778 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	NAB2	Q15742	525 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	FAM20A	Q96MK3	541 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PSMD1	Q99460	953 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PARVG	Q9HBI0	331 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GMNC	A6NCL1	334 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	DCTN3	O75935	186 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PPP2R2A	P63151	447 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	7.23	□□□□□ -1.25	2e-6	■■■■□ 21.5
ACACA-231	ENST00000614428	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PDXK	O00764	312 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ENC1	O14682	589 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GAS7	O60861	476 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	LIG3	P49916	1009 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	IFT88	Q13099	833 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PPP2R5A	Q15172	486 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	RAD54L	Q92698	747 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	NACC1	Q96RE7	527 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ABCA3	Q99758	1704 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PJA2	O43164	708 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PPP1R37	O75864	691 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ATP2B4	P23634	1241 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	NAA25	Q14CX7	972 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MREG	Q8N565	214 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SAMM50	Q9Y512	469 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TBCK	Q8TEA7	893 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ANKS1A	Q92625	1134 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ATP2A3	Q93084	1043 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CARD9	Q9H257	536 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TMEM232	C9JQI7	657 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	EXOC3	O60645	756 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MUT	P22033	750 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ZBTB16	Q05516	673 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	OGFOD1	Q8N543	542 aa		7.22	□□□□□ -1.25

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