RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613947.1

CCL4-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 4, humanhuman

Gene CCL4, Length 1,774 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4-201ENST00000613947 DGKDQ16760 1214 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 Q4G0T1 1027 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 MCTP1Q6DN14 999 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 MBOAT7Q96N66 472 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 WNT7AO00755 349 aa14.52□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 SLC37A4O43826 429 aa14.52□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 PPFIA4O75335 1185 aa14.52□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.52□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 GJA10Q969M2 543 aa14.52□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 GPR20Q99678 358 aa14.52□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 SDF4Q9BRK5 362 aa14.52□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.52□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.52□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 NFASCO94856 1347 aa14.52□□□□□ -0.08
CCL4-201ENST00000613947 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 CABYRO75952 493 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 UQCRHP07919 91 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 ATP2B1P20020 1258 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 PDCP20941 246 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 RBSNQ9H1K0 784 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 ELP1O95163 1332 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 KPNA6O60684 536 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 ZNF286BP0CG31 522 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 SYT1P21579 422 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 PSMC6P62333 389 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 KAT2BQ92831 832 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 GRIN2DO15399 1336 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 SLC5A5Q92911 643 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 MBD3O95983 291 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 CCNE2O96020 404 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 CHMP4BP1P59074 171 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 ACTR2P61160 394 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 POTEDQ86YR6 584 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 LGALS2P05162 132 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 ITGA7Q13683 1181 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 SNX17Q15036 470 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 TRIM50Q86XT4 487 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 DPF3Q92784 378 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 HAS1Q92839 578 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 RIT2Q99578 217 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 ARVCFO00192 962 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 GAS7O60861 476 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 PSMD10O75832 226 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 F2P00734 622 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 MCM7P33993 719 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 CDK7P50613 346 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 RTP1P59025 263 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 ZNF174Q15697 407 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 TRIM60Q495X7 471 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 FERMT3Q86UX7 667 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 FAM13BQ9NYF5 915 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 ALPK3Q96L96 1907 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 H3BRB1 525 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 STX6O43752 255 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 NEMFO60524 1076 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 ATG7O95352 703 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 TRAPPC10P48553 1259 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 KRT76Q01546 638 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL4-201ENST00000613947 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms