RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596148.2

TRAPPC5-204, Transcript of trafficking protein particle complex 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC5, Length 5,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5-204ENST00000596148 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
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TRAPPC5-204ENST00000596148 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.92■■□□□ 1.1
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TRAPPC5-204ENST00000596148 SFNP31947 248 aa21.91■■□□□ 1.1
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TRAPPC5-204ENST00000596148 PCIF1Q9H4Z3 704 aa21.91■■□□□ 1.1
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TRAPPC5-204ENST00000596148 MTMR1Q13613 665 aa21.9■■□□□ 1.1
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TRAPPC5-204ENST00000596148 PROM2Q8N271 834 aa21.9■■□□□ 1.1
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TRAPPC5-204ENST00000596148 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
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TRAPPC5-204ENST00000596148 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
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TRAPPC5-204ENST00000596148 VSTM4Q8IW00 320 aa21.9■■□□□ 1.1
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TRAPPC5-204ENST00000596148 ZBTB33Q86T24 672 aa21.87■■□□□ 1.09
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TRAPPC5-204ENST00000596148 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC5-204ENST00000596148 SLC35F6Q8N357 371 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC5-204ENST00000596148 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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TRAPPC5-204ENST00000596148 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC5-204ENST00000596148 S100BP04271 92 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC5-204ENST00000596148 DDIT3P35638 169 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC5-204ENST00000596148 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.86■■□□□ 1.09
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