RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591652.1

ZNF559-209, Transcript of zinc finger protein 559, human

TSL 3

Gene ZNF559, Length 692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF559-209	ENST00000591652	FSHB	P01225	129 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	GNAT1	P11488	350 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652		Q6ZUG5	572 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	OSBP2	Q969R2	916 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	KCNJ15	Q99712	375 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	FBXO21	O94952	628 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	C6	P13671	934 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	GPR85	P60893	370 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	STYK1	Q6J9G0	422 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	GML	Q99445	158 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	DEF6	Q9H4E7	631 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	KCND1	Q9NSA2	647 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	SRRD	Q9UH36	339 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	BLACE	A4D250	179 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	SOD2	P04179	222 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	TACR2	P21452	398 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	GLRB	P48167	497 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	EPHA5	P54756	1037 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	PFKP	Q01813	784 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	CD276	Q5ZPR3	534 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	NSMF	Q6X4W1	530 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652		Q8N1X5	172 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	STPG3	Q8N7X2	389 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	AJUBA	Q96IF1	538 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	DSE	Q9UL01	958 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF839	A8K0R7	811 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF623	O75123	536 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	CSF2RB	P32927	897 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	SELENOP	P49908	381 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	KCTD1	Q719H9	257 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	PALM2	Q8IXS6	379 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	ASXL2	Q76L83	1435 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	ACOT7	O00154	380 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	IL18BP	O95998	194 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652		Q8TCH9	128 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF747	Q9BV97	191 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	KATNBL1	Q9H079	304 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	IPPK	Q9H8X2	491 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	GDF5	P43026	501 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	RAB33A	Q14088	237 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	VPS11	Q9H270	941 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652		H0Y858	1186 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	MUSK	O15146	869 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	AMH	P03971	560 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	ACVRL1	P37023	503 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	DPH6	Q7L8W6	267 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	GNRHR2	Q96P88	292 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	LMF1	Q96S06	567 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	ALG1	Q9BT22	464 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	CD244	Q9BZW8	370 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ZNF559-209	ENST00000591652	FOXS1	O43638	330 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ZNF559-209	ENST00000591652	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ZNF559-209	ENST00000591652	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ZNF559-209	ENST00000591652	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ZNF559-209	ENST00000591652	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF428	Q96B54	188 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ZNF559-209	ENST00000591652	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ZNF559-209	ENST00000591652	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ZNF559-209	ENST00000591652	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		5.83	□□□□□ -1.48

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