RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 SGSM2O43147 1006 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR37L1O60883 481 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TIGD5Q53EQ6 642 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CUL5Q93034 780 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 BRWD1Q9NSI6 2320 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 DOCK5Q9H7D0 1870 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 DDAH1O94760 285 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRNA1P02708 482 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 XRRA1Q6P2D8 792 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 RUFY4Q6ZNE9 571 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 GJD3Q8N144 294 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 BANK1Q8NDB2 785 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 NEK9Q8TD19 979 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K14Q99558 947 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 NRCAMQ92823 1304 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BQ06 376 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TCEAL5Q5H9L2 206 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 NLRX1Q86UT6 975 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 GRXCR2A6NFK2 248 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP9AO75110 1047 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHA8P1O95397 391 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 GHRP10912 638 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP4K1Q92918 833 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
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CAPNS1-211ENST00000590874 KIF5BP33176 963 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 RPAINQ86UA6 219 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
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CAPNS1-211ENST00000590874 ITGB5P18084 799 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SMARCA1P28370 1054 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 MGAT3Q09327 533 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 GPRASP2Q96D09 838 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 IL17RAQ96F46 866 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 EHMT1Q9H9B1 1298 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00271P0C7V0 271 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 MARK3P27448 753 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PPFIA1Q13136 1202 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 LPIN1Q14693 890 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 COL19A1Q14993 1142 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF2Q6P1X5 1199 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PRC1O43663 620 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 RXRAP19793 462 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 CTNNB1P35222 781 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 FIBCD1Q8N539 461 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 LZTS2Q9BRK4 669 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIK4Q16099 956 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2SQ16763 222 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 CASC1Q6TDU7 716 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 EP400NLQ6ZTU2 488 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SEPT1Q8WYJ6 367 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PSTPIP2Q9H939 334 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PKD2L1Q9P0L9 805 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBE1Q9UJT0 475 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 C5orf67F2Z3F1 127 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 GNAQP50148 359 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 MARCH8Q5T0T0 291 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 NFXL1Q6ZNB6 911 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJB3Q8WWF6 145 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 CDHR1Q96JP9 859 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 MTA3Q9BTC8 594 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ERAP1Q9NZ08 941 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB10Q96DT7 871 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-211ENST00000590874 NLRC5Q86WI3 1866 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ENPP3O14638 875 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 GRM6O15303 877 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 MTMR1Q13613 665 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO47Q5MNV8 452 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 RSPH3Q86UC2 560 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 GLG1Q92896 1179 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDND1Q9NY35 253 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CDY2AQ9Y6F7 541 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC69A6NI79 296 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 BMPR1AP36894 532 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR33A8MZF0 331 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 RB1P06400 928 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 MCM5P33992 734 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 LTBRP36941 435 aa29.42■■■□□ 2.3
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