RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 CCNE2O96020 404 aa29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 MUTP22033 750 aa29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 ADORA2AP29274 412 aa29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 UVSSAQ2YD98 709 aa29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 CNNM4Q6P4Q7 775 aa29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 MIER3Q7Z3K6 550 aa29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 B4DLN1 442 aa29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 TM4SF4P48230 202 aa29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT76Q01546 638 aa29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF792Q3KQV3 632 aa29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR142Q7Z601 462 aa29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 NEK9Q8TD19 979 aa29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 PLA2G4BP0C869 781 aa29.1■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 MAPK4P31152 587 aa29.1■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNB1Q14721 858 aa29.1■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 RMND1Q9NWS8 449 aa29.1■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 DOCK5Q9H7D0 1870 aa29.09■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 TLR2O60603 784 aa29.09■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 COBLO75128 1261 aa29.09■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC12A3P55017 1021 aa29.09■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 SP2Q02086 613 aa29.09■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 GRB14Q14449 540 aa29.09■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP4F22Q6NT55 531 aa29.09■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 C17orf99Q6UX52 265 aa29.09■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
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SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 SENP7Q9BQF6 1050 aa29.09■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 BCAS3Q9H6U6 928 aa29.09■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 DNM3Q9UQ16 869 aa29.09■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa29.09■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF236Q9UL36 1845 aa29.09■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 TPH2Q8IWU9 490 aa29.08■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 LRRC27Q9C0I9 530 aa29.08■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 MCM3APO60318 1980 aa29.08■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 KMT5BQ4FZB7 885 aa29.08■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 SEPT14Q6ZU15 432 aa29.08■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 LXNQ9BS40 222 aa29.08■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR64B1ANS9 1081 aa29.07■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 RHOBTB3O94955 611 aa29.07■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 SFNP31947 248 aa29.07■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 JAK3P52333 1124 aa29.07■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 ASIC1P78348 528 aa29.07■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 PLEKHH3Q7Z736 793 aa29.07■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 BANK1Q8NDB2 785 aa29.07■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 P4HBP07237 508 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 RDM1Q8NG50 284 aa29.06■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 DDX12PQ92771 950 aa29.06■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJC19Q96DA6 116 aa29.06■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 EYA4O95677 639 aa29.06■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP11B2P19099 503 aa29.06■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 AOPEPQ8N6M6 819 aa29.06■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 ASB14A6NK59 587 aa29.05■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 DYMQ7RTS9 669 aa29.05■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa29.05■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC9A2Q9UBY0 812 aa29.05■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa29.05■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 SAMM50Q9Y512 469 aa29.05■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa29.04■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 RASSF10A6NK89 507 aa29.04■■■□□ 2.24
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SCAMP4-210ENST00000588555 GRM1Q13255 1194 aa29.04■■■□□ 2.24
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SCAMP4-210ENST00000588555 ARSHQ5FYA8 562 aa29.04■■■□□ 2.24
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SCAMP4-210ENST00000588555 TELO2Q9Y4R8 837 aa29.04■■■□□ 2.24
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SCAMP4-210ENST00000588555 SLC15A5A6NIM6 579 aa29.03■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 ZBTB39O15060 712 aa29.03■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 LYPLA2O95372 231 aa29.03■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 QARSP47897 775 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 NOGQ13253 232 aa29.03■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 ARMCX2Q7L311 632 aa29.03■■■□□ 2.24
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