RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580784.5

CSNK1D-215, Transcript of casein kinase 1 delta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSNK1D, Length 1,081 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1D-215ENST00000580784 RPS6KB1P23443 525 aa24.36■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 DEFB103AP81534 67 aa24.36■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24.36■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 SEPT1Q8WYJ6 367 aa24.36■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.36■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 CERS4Q9HA82 394 aa24.36■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 TMEM260Q9NX78 707 aa24.36■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.35■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa24.35■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 KIF28PB7ZC32 967 aa24.35■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 ARHGEF15O94989 841 aa24.35■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 FOSP01100 380 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 GNAT1P11488 350 aa24.35■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 IKBKEQ14164 716 aa24.35■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 ANO3Q9BYT9 981 aa24.35■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 KCNH7Q9NS40 1196 aa24.35■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 VCANP13611 3396 aa24.35■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 TRANK1O15050 2925 aa24.34■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 TLL1O43897 1013 aa24.34■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 LGR5O75473 907 aa24.34■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 ADAM17P78536 824 aa24.34■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 ARHGAP4P98171 946 aa24.34■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.34■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.34■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 EMSYQ7Z589 1322 aa24.34■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 RFXAPO00287 272 aa24.33■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 NEFLP07196 543 aa24.33■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 ARP10275 920 aa24.33■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 PSMA5P28066 241 aa24.33■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 TAP1Q03518 808 aa24.33■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 FBXL16Q8N461 479 aa24.33■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.33■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 ZBED2Q9BTP6 218 aa24.33■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.33■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.33■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 PRDM6Q9NQX0 595 aa24.33■■□□□ 1.49
CSNK1D-215ENST00000580784 NRCAMQ92823 1304 aa24.33■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 CTSHP09668 335 aa24.32■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 SCG2P13521 617 aa24.32■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 MARK3P27448 753 aa24.32■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 GLG1Q92896 1179 aa24.32■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.32■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 ERAP1Q9NZ08 941 aa24.32■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 MICAL3Q7RTP6 2002 aa24.32■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 LCHNA4D1U4 455 aa24.31■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 ADAMTS3O15072 1205 aa24.31■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 EFCAB14O75071 495 aa24.31■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 SREBF1P36956 1147 aa24.31■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 AP3B2Q13367 1082 aa24.31■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 PKN1Q16512 942 aa24.31■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 CEP55Q53EZ4 464 aa24.31■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.31■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 PHKBQ93100 1093 aa24.31■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa24.31■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC9A2Q9UBY0 812 aa24.31■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 REV3LO60673 3130 aa24.3■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 NID2Q14112 1375 aa24.3■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 EPOPA6NHQ4 379 aa24.3■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 MEIS1O00470 390 aa24.3■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 PPFIA3O75145 1194 aa24.3■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 CAND2O75155 1236 aa24.3■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 PPFIA1Q13136 1202 aa24.3■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.3■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 FAM117BQ6P1L5 589 aa24.3■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 SPRED2Q7Z698 418 aa24.3■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 ARNTL2Q8WYA1 636 aa24.3■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 PCYT2Q99447 389 aa24.3■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 GJB5O95377 273 aa24.29■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF76P36508 570 aa24.29■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.29■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 SDF4Q9BRK5 362 aa24.29■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 ZMYND12Q9H0C1 365 aa24.29■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 NFASCO94856 1347 aa24.29■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 ACTR2P61160 394 aa24.28■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 GRIK4Q16099 956 aa24.28■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 NTRK3Q16288 839 aa24.28■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 RUFY3Q7L099 469 aa24.28■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 RAD9AQ99638 391 aa24.28■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.28■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 ESYT2A0FGR8 921 aa24.27■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 EVCP57679 992 aa24.27■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 FAM26DQ5JW98 314 aa24.27■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.27■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 SEPT8Q92599 483 aa24.27■■□□□ 1.48
CSNK1D-215ENST00000580784 AZI2Q9H6S1 392 aa24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms