RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580738.5

NDEL1-209, Transcript of nudE neurodevelopment protein 1 like 1, humanhuman

TSL 2

Gene NDEL1, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1-209ENST00000580738 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.17■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.17■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.17■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 ADAM15Q13444 863 aa22.16■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 CAMK1Q14012 370 aa22.16■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 IER5LQ5T953 404 aa22.16■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 METTL7BQ6UX53 244 aa22.16■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 PRSS33Q8NF86 280 aa22.16■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 EDAQ92838 391 aa22.16■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.16■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.16■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 CD207Q9UJ71 328 aa22.16■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.16■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 USP34Q70CQ2 3546 aa22.15■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.15■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 ENPP3O14638 875 aa22.15■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 ICAM3P32942 547 aa22.15■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.15■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 PIGSQ96S52 555 aa22.15■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.15■■□□□ 1.14
NDEL1-209ENST00000580738 MMP1P03956 469 aa22.14■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 SP4Q02446 784 aa22.14■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 NEDD9Q14511 834 aa22.14■■□□□ 1.13
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NDEL1-209ENST00000580738 SEC23AQ15436 765 aa22.14■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 GNPTABQ3T906 1256 aa22.14■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 SNX27Q96L92 541 aa22.14■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 KRT23Q9C075 422 aa22.14■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 LNPKQ9C0E8 428 aa22.14■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.14■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 LAMA4Q16363 1823 aa22.13■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 DNAJB1P25685 340 aa22.13■■□□□ 1.13
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NDEL1-209ENST00000580738 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 NRCAMQ92823 1304 aa22.12■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 DGKIO75912 1065 aa22.12■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 NDUFV1P49821 464 aa22.12■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 MGAT3Q09327 533 aa22.12■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.12■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.12■■□□□ 1.13
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NDEL1-209ENST00000580738 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.12■■□□□ 1.13
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NDEL1-209ENST00000580738 PLVAPQ9BX97 442 aa22.12■■□□□ 1.13
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NDEL1-209ENST00000580738 CLEC1BQ9P126 229 aa22.12■■□□□ 1.13
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NDEL1-209ENST00000580738 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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NDEL1-209ENST00000580738 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.11■■□□□ 1.13
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NDEL1-209ENST00000580738 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.09■■□□□ 1.13
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NDEL1-209ENST00000580738 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.09■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 P2RX5Q93086 422 aa22.09■■□□□ 1.13
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NDEL1-209ENST00000580738 TCF15Q12870 199 aa22.08■■□□□ 1.13
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NDEL1-209ENST00000580738 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.08■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 EFHBQ8N7U6 833 aa22.08■■□□□ 1.13
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NDEL1-209ENST00000580738 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.08■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 SENP2Q9HC62 589 aa22.08■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.08■■□□□ 1.13
NDEL1-209ENST00000580738 CD52P31358 61 aa22.07■■□□□ 1.12
NDEL1-209ENST00000580738 NRIP1P48552 1158 aa22.07■■□□□ 1.12
NDEL1-209ENST00000580738 COASYQ13057 564 aa22.07■■□□□ 1.12
NDEL1-209ENST00000580738 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.07■■□□□ 1.12
NDEL1-209ENST00000580738 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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