RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 RB1P06400 928 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 GNPTABQ3T906 1256 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 METTL7BQ6UX53 244 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 PIGSQ96S52 555 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 KRT23Q9C075 422 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 TECTAO75443 2155 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 STXBP3O00186 592 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 CHRNA1P02708 482 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 SEMA3FQ13275 785 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 FAM26DQ5JW98 314 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 CD207Q9UJ71 328 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 NDUFV1P49821 464 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 ADAM17P78536 824 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 NEDD9Q14511 834 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 SEC23AQ15436 765 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 MMP1P03956 469 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 LPIN1Q14693 890 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 PRSS33Q8NF86 280 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 FIBPO43427 364 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 ICAM3P32942 547 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 EDAQ92838 391 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 MGAT3Q09327 533 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 CAMK1Q14012 370 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 GRM4Q14833 912 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 IER5LQ5T953 404 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 TTC3P53804 2025 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 NRCAMQ92823 1304 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM221A6NGB7 291 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 M0R296 226 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 ENPP3O14638 875 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 CYTH3O43739 400 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 STAM2O75886 525 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 DNAJB1P25685 340 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 MARK3P27448 753 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 ADAM15Q13444 863 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 KMT2EQ8IZD2 1858 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 DGKIO75912 1065 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 TRAF1Q13077 416 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 PPFIA1Q13136 1202 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 SNX27Q96L92 541 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 SENP2Q9HC62 589 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 ITGB1P05556 798 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 GRIK4Q16099 956 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 RSPH3Q86UC2 560 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 PLVAPQ9BX97 442 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 CLEC1BQ9P126 229 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 CD52P31358 61 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 NRIP1P48552 1158 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms