RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	GPR20	Q99678	358 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	CLDND1	Q9NY35	253 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	GRM6	O15303	877 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	STAM2	O75886	525 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	CHRNA1	P02708	482 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	IRS1	P35568	1242 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	BMPR1A	P36894	532 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	NEDD9	Q14511	834 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	PIGS	Q96S52	555 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	HIP1	O00291	1037 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	CYTH3	O43739	400 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	CTNNB1	P35222	781 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	HYAL1	Q12794	435 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	GRM4	Q14833	912 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	HOMER1	Q86YM7	354 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	FIBP	O43427	364 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	MBTPS2	O43462	519 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	EVPL	Q92817	2033 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	ENPP3	O14638	875 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	GHR	P10912	638 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	LPIN1	Q14693	890 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	MYO10	Q9HD67	2058 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	TBX10	O75333	385 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	MMP1	P03956	469 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	MGAT3	Q09327	533 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	TROAP	Q12815	778 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	ADAM15	Q13444	863 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	CAMK1	Q14012	370 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	CLUL1	Q15846	466 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	RNF135	Q8IUD6	432 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	IL25	Q9H293	177 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	DGKI	O75912	1065 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	SP4	Q02446	784 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	NUCB1	Q02818	461 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	P2RX5	Q93086	422 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	CD207	Q9UJ71	328 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	STXBP3	O00186	592 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	LINC01565	O15544	149 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	EYA4	O95677	639 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31

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