RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565589.5

RNPS1-215, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-215	ENST00000565589	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	GPM6B	Q13491	265 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	MBTPS1	Q14703	1052 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	TTC22	Q5TAA0	569 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	9.64	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	MAP4K1	Q92918	833 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	AZI2	Q9H6S1	392 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	CCDC69	A6NI79	296 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	CYTH3	O43739	400 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	ARHGEF15	O94989	841 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	STAG3L1	P0CL83	205 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	KCNA5	P22460	613 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	CHML	P26374	656 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	BMPR1A	P36894	532 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	ARHGAP4	P98171	946 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	KRT40	Q6A162	431 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	MCTP2	Q6DN12	878 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	P2RX5	Q93086	422 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	SETD4	Q9NVD3	440 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	COL4A6	Q14031	1691 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	MEIS2	O14770	477 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	SGSM2	O43147	1006 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	PPFIA1	Q13136	1202 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	MTMR1	Q13613	665 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	RNF20	Q5VTR2	975 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	GLG1	Q92896	1179 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	PRRX2	Q99811	253 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	LCT	P09848	1927 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	POTEB3	A0JP26	581 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	CARNS1	A5YM72	827 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	ENPP3	O14638	875 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	DCX	O43602	365 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	UPP2	O95045	317 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	POTEB	Q6S5H4	581 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	IL31RA	Q8NI17	732 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	WNT8B	Q93098	351 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	SDF4	Q9BRK5	362 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	JADE2	Q9NQC1	790 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	AAAS	Q9NRG9	546 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	NFASC	O94856	1347 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	DGKI	O75912	1065 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	CHRNA1	P02708	482 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	CTSH	P09668	335 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	KCNA2	P16389	499 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	CTNNB1	P35222	781 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	RCAN1	P53805	252 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	UBE3A	Q05086	875 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	SEMA3F	Q13275	785 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	HIC1	Q14526	733 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	GRIK4	Q16099	956 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	TCTN1	Q2MV58	587 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		9.6	□□□□□ -0.87
RNPS1-215	ENST00000565589	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms